Лаборатория мицелиальных грибов

 

-  входит в состав Отдела «Всероссийская коллекция микроорганизмов»,  создана в 2011 г. на базе сектора мицелиальных грибов отдела ВКМ.

 

Руководитель лаборатории Озерская Светлана Михайловна, д.б.н., в.н.с. smovkm@gmail.com

Озерская Светлана Михайловна


Работает в ИБФМ РАН с 1985 года. Окончила кафедру биологии почв Факультета почвоведения МГУ им. М.В.Ломоносова, там же защитила кандидатскую диссертацию по экологии микроскопических почвенных грибов. Научные интересы связаны с изучением разнообразия грибов в коллекциях культур, условий выделения грибов и сохранения их жизнеспособности.

В 2012 году защитила докторскую диссертацию на тему: «Грибы в коллекциях культур: фундаментальные и прикладные аспекты».

Автор более 130 статей. В числе наиболее значимых результатов считает создание базы данных по разнообразию мирового коллекционного фонда культур грибов, FungalDC (Fungal diversity in culture collections), которая связана с основными микологическими (микробиологическими) информационными ресурсами (Index Fungorum, MycoBank, GenBank, WDCM). FungalDC работает в режиме свободного доступа на сайте ВКМ (www.vkm.ru).

Кочкина Галина Александровна, к.б.н., с.н.с.

Иванушкина Наталия Евгеньевна, к.б.н., с.н.с.

Сотрудники лаборатории

Озерская Светлана Михайловна, д.б.н., в.н.с.

Иванушкина Наталия Евгеньевна, к.б.н., с.н.с.

Кочкина Галина Александровна, к.б.н., с.н.с.

Данилогорская Анастасия Александровна, н.с.

Крючкова Маргарита Олеговна, м.н.с.

Сайнчук Александра Денисовна, и.о. м.н.с.

Князева Елена Владимировна, вед. инж.

Князева Александра Владимировна, инж.

Мороз Наталья Сергеевна, ст. лаб.

 

Основные направления деятельности

Поддержание и изучение фонда мицелиальных грибов ВКМ – группы микроорганизмов, обладающих высоким биотехнологическим потенциалом, пополнение фонда новыми штаммами, изучение жизнеспособности культур разных таксонов в процессе длительного хранения различными методами, создание информационных банков данных по грибам и  каталогизация имеющейся информации по штаммам грибного фонда ВКМ. Большое внимание уделяется вопросам систематики, таксономии и номенклатуры грибов.
Научные исследования связаны, главным образом, с изучением разнообразия культивируемых и некультивируемых грибов в различных, в т.ч., экстремальных местообитаниях (арктические и антарктические глубинные многолетнемерзлые отложения, вулканические мерзлые пеплы Камчатки, криопэги, воды глубинных антарктических озер и др.), оценкой их потенциально полезных и потенциально опасных свойств.

Фонд мицелиальных грибов ВКМ

Фонд включает более 4500   штаммов, представителей всех групп грибов, традиционно поддерживаемых в коллекциях культур – оомицеты, зигомицетовые грибы, аскомицеты и базидиомицеты, включая их анаморфные стадии.

Каталожная база данных ВКМ (БД) по штаммам фонда содержит всю имеющуюся информацию по каждому объекту, с возможностью вывода данных по «открытым» штаммам в он-лайн каталог (http://www.vkm.ru/сatalogue.htm).

Работа по поддержанию фонда полностью соответствует международным стандартам коллекционного дела, ведется на основе и с использованием известных рекомендаций, опубликованных в руководстве Организации по экономическому содействию и развитию (ОЭСР - OECD best practice guidelines for biological resource centres. OECD, 2007, 115 p.).

). БД позволяет вести поиск штаммов в интерактивном режиме по научным названиям, коллекционным номерам, названиям метаболитов. БД интегрирована в Глобальный каталог микроорганизмов (Global catalogue of microorganisms – GCM, http://gcm.wfcc.info/), развиваемый Всемирным центром данных по микроорганизмам (WDCM) Всемирной федерации коллекций культур (WFCC) и инфраструктуру микробных коллекций Европы – MIRRI (Microbial Resource Research Infrastructure).

Сведения по мицелиальным грибам ВКМ включены в открытый каталог на сайте ВКМ – www.vkm.ru.

Основные публикации за пять лет:

  1. Casaregola S., Vasilenko A., Romano P., Robert V., Ozerskaya S., Kopf A., Glöckner F.O., Smith D. An information system for European culture collections: the way forward. SpringerPlus, 2016, 5: 772-783. DOI: /10.1186/s40064-016-2450-8

Козловский А.Г., Антипова Т.В., Желифонова В.П., Баскунов Б.П., Кочкина Г.А., Озерская С.М. Экзометаболиты грибов секции Chrysogena рода Penicillium, выделенных из низкотемпературных экотопов. Микробиология, 2016, 85(2): 145-153. DOI: 10.7868/S0026365616020129

Мысякина И.С., Кочкина Г.А., Иванушкина Н.Е., Бокарева Д.А., Ивашечкин А.А., Феофилова Е.П. Прорастание спор мицелиальных грибов в связи с экзогенным покоем. Микробиология, 2016, 85(3): 269-274. DOI: 10.7868/S0026365616030101

Роговина С.З., Алексанян К.В., Косарев А.А., Иванушкина Н.Е., Прут Э.В., Берлин А.А. Биоразлагаемые полимерные композиции на основе полполилактида и целлюлозы. Высокомолекулярные соединения. Серия Б, 2016, 58(1): 43–52.

Marfenina O.E., Danilogorskaya A.A. Effect of elevated temperatures on composition and diversity of microfungal communities in natural and urban boreal soils, with emphasis on potentially pathogenic species. Pedobiologia, 2017, 60:  P.11–19. https://doi.org/10.1016/j.pedobi.2016.11.002

, 2017, 45(D1): D611-D618. https://doi.org/10.1093/nar/gkw903

Козловский А.Г., Антипова Т.В., Желифонова В.П., Баскунов Б.П., Иванушкина Н.Е., Кочкина Г.А., Озерская С.М. Вторичные метаболиты грибов секции Usti рода Aspergillus и их использование в хемосистематике. Микробиология, 2017, 86(2): 164-171. DOI: 10.7868/S0026365617020112

, 2018, 28(1): 55–57. https://doi.org/10.1016/j.mencom.2018.01.018

Антипова Т.В., Желифонова В.П., Баскунов Б.П., Кочкина Г.А., Озерская С.М., Козловский А.Г. Экзометаболиты грибов рода Penicillium, выделенных из различных экосистем высоких широт. Микробиология, 2018, 87(5): 519-529. DOI: 10.1134/S0026365618050038 

, 2018, 28(1): 105–107. https://doi.org/10.1016/j.mencom.2018.01.036

, 2018, 70: 1700268. https://doi.org/10.1002/star.201700268

, 2018, 26(4): 1727-1736. https://doi.org/10.1007/s10924-017-1069-3

, 2019, 29(22): 126708. https://doi: 10.1016/j.bmcl.2019.126708

Crous P.W., Wingfield M.J., Lombard L., Roets F., Swart W.J., …, Ivanushkina N.E., Kochkina G.A., Ozerskaya S.M., … Fungal Planet description sheets: 951–1041. Persoonia, 2019, 43: 223-425. https://doi.org/10.3767/persoonia.2019.43.06

, 2019, 42: 47-64. https://doi.org/10.1007/s00300-018-2398-y

, 2019, 136(22): 47598. https://doi.org/10.1002/app.47598

, 2020, 65: 95-102. https://doi.org/10.1007/s12223-019-00708-0

Жорина Л.А., Роговина С.З., Прут Э.В., Кузнецова О.П., Грачев А.В., Иванушкина Н.Е., Иорданский А.Л., Берлин А.А.  Биоразлагаемые композиции на основе полиэфиров поли-(3-гидроксибутирата) и полилактида, получаемых из растительного сырья Высокомолекулярные соединения. Серия А, 2020, 62(4): 263-270. DOI: 10.31857/S2308112020040136

Кочкина Г.А., Иванушкина Н.Е., Антипова Т.В., Желифонова В.П., Козловский А.Г., Озерская С.М. Грибы многолетней мерзлоты: разнообразие, метаболиты, адаптация. История науки и техники, 2020, 11: 19-35.

, 2021, 21(9). https://doi.org/10.1089/ast.2020.2296

2021, 61(3): 802–809. https://doi.org/10.1002/pen.25624

Озерская С.М., Абсалямов С.Я., Кочкина Г.А., Иванушкина Н.Е., Василенко А.Н. База данных по библиографии о штаммах микроорганизмов ВКМ. Свидетельство о государственной регистрации базы данных № 2021620998. Дата поступления 27 марта 2021 г. Дата государственной регистрации в Реестре баз данных 18 мая 2021 г.

Озерская С.М., Кочкина Г.А., Иванушкина Н.Е., Василенко А.Н. База данных по длительному хранению культур микроорганизмов ВКМ. Свидетельство о государственной регистрации базы данных № 2021620726. Дата поступления 27 марта 2021 г. Дата государственной регистрации в Реестре баз данных 15 апреля 2021 г.

 

142290 Московская область, г.Пущино, пр-т Науки, д.5, Тел.: +7(4967)733962,  adm@ibpm.ru, www.ibpm.ru

Разработка сайта - Alces