Лаборатория биологии и геносистематики дрожжевых грибов

создана в 2021 г. в рамках проекта Федеральной научно-технической программы развития генетических технологий на 2019-2027 годы (Соглашение между Министерством науки и высшего образования Российской Федерации и ФИЦ ПНЦБИ РАН от 28 сентября 2021г. № 075-15-2021-1051 и Федеральным государственным бюджетным учреждением науки «Федеральный исследовательский центр «Пущинский научный центр биологических исследований Российской академии науки»).

Руководитель А.В. Качалкин, вед.н.с., к.б.н.

kachalkin_a@mail.ru
Работает в ИБФМ РАН с 2018 г
Окончил каф. биологии почв факультета почвоведения МГУ им. Ломоносова. Область научных интересов: экология и систематика дрожжевых грибов, дрожжевые грибы в экстремальных и малоизученных местообитаниях, география дрожжей. Автор более 80 публикаций, посвященных дрожжевым грибам. А.В. Качалкиным описано 20 новых видов дрожжей.

В.И. Голубев, вед.н.с., д.б.н.

wig@ibpm.pushchino.ru
Работает в ИБФМ РАН с 1971 г
Окончил каф. биологии почв Биолого-почвенного факультета МГУ им. Ломоносова. Автор свыше 200 публикаций, посвященных различным аспектам экологии и таксономии дрожжевых грибов
В.И. Голубевым описано около 30 новых видов и три новых рода этой группы организмов. 
Профессор Пущинского государственного естественно-научного института. Член научно-редакционного совета журнала «Проблемы медицинской микологии». Имеет опыт работы в зарубежных организациях: в Центральной коллекции грибов (CBS, Нидерланды) и Японской коллекции микроорганизмов.

Сотрудники сектора

Качалкин Алексей Владимирович, вед. н.с.

Голубев Владислав Иванович, вед.н.с., д.б.н.

Барышникова Лидия Михайловна Ст. н. с., к.б.н.

Ступарь Олег Сергеевич  Ст. н. с., к.б.н.

Глушакова Анна Марковна Ст. н. с., к.б.н.

Томашевская Мария Андреевна, н.с.

Присяжная Наталья Викторовна н.с.

Иванова Вера Васильевна, ст. лаб.

Перевертина Татьяна Александровна, ст. лаб.

Основные направления деятельности

Исследовательская деятельность лаборатории связана преимущественно с изучением   таксономического разнообразия дрожжевых грибов – вновь изолированных из различных биотопов и сохраняемых в фонде ВКМ, выявлением и описанием новых таксонов с использованием современных методов геносистематики и информации о фенотипических характеристиках.

Коллективом лаборатории поддерживается коллекция дрожжей ВКМ – самая  представительная среди дрожжевых коллекций стран бывшего СССР и одна из крупнейших в мире по численности и видовому разнообразию. Фондвключает более 2900 культур дрожжей, представителей более чем 750  видов  (в их числе  типовые штаммы видов), входящих в состав более 170 родов и шести подотделов эумицетов. Штаммы выделены из разнообразных природных образцов всех континентов.

Более 260 штаммов дрожжей были депонированы в ВКМ в 2021 г., в рамках проекта Программы развития генетических технологий. Культуры, принятые в фонд на первом этапе реализации проекта, являются представителями редких таксонов и 74 видов, отсутствовавших ранее в коллекции, а также штаммы пока не описанных новых видов и штаммы с биотехнологическим потенциалом.

Помимо пополнения, регулярно проводится таксономическая и номенклатурная ревизии фонда, проверка жизнеспособности и аутентичности штаммов.

Основные публикации

Бабьева И.П., Голубев В.И. Методы выделения и идентификации дрожжей. Изд-во "Пищевая промышленность", М., 1979, 120 с.
Golubev W.I., Perfect state of Rhodomyces dendrorhous(Phaffia rhodozyma). Yeast, 1995, 11(2): 101-110.
Golubev W.I., 1998. Mycocins (killer toxins), рр. 55-62. In: The Yeasts: A Taxonomic Study (C.P. Kurtzman, J.W. Fell, eds.). Elsevier Sci. B.V., Amsterdam.
Golubev W., Pfeiffer I., Golubeva E. Mycocin production in Trichosporon pullulans populations colonizing tree exudates in the spring. FEMS Microbiology Ecology, 2002, 40(2): 151-157.
Golubev W.I. Antagonistic interactions among yeasts, pp. 197-219. In: The Yeast Handbook. “Biodiversity and Ecophysiology of Yeasts” (eds. C.A. Rosa, G. Peter). Springer-Verlag, Berlin, 2006.
Golubev W., Sugita T., Golubev N. An ustilaginomycetous yeast, Pseudozyma graminicola sp. nov., isolated from the leaves of pasture plants. Mycoscience, 2007, 48(1): 29-33.
Golubev W.I., Sampaio J.P. New filobasidiaceous yeasts found in the phylloplane of a fern. J. Gen. Appl. Microbiol. 2009, 55(6): 441-446.
Golubev W.I., Scorzetti G. Rhodotorula rosulata sp. nov., Rhodotorula silvestris sp. nov. and Rhodotorula straminea sp. nov., novel myo-inositol-assimilating yeast species in the Microbotryomycetes. Int. J. System. Evol. Microbiol. 2010, 60(10): 2501-2506.
Golubev W.I. Mastigobasidium Golubev (1999), рр. 1495-1497. In: The Yeasts, a Taxonomic Study, Vol. 3, 5th ed. (C.P. Kurtzman, J.W. Fell and T. Boekhout, eds.). Elsevier Sci. Publ. B.V., Amsterdam, 2011.
Голубев В.И., Микоцинотипирование. Микология и фитопатология, 2012, 46(1): 3-13.

Kachalkin A., Yurkov A. Yeast communities in Sphagnum phyllosphere along the temperature-moisture ecocline in the boreal forest-swamp ecosystem and description of Candida sphagnicola sp. nov. Antonie van Leeuwenhoek. 2012, 102(1): 29-43.

Kachalkin A.V. Yeasts of the White Sea intertidal zone and description of Glaciozyma litorale sp. nov. Antonie van Leeuwenhoek. 2014, 105(6): 1073-1083.

Yurkov A.M., Kachalkin A.V., Daniel H.M., Groenewald M., Libkind D., et al. Two yeast species Cystobasidium psychroaquaticum f.a. sp. nov. and Cystobasidium rietchieii f.a. sp. nov. isolated from natural environments, and the transfer of Rhodotorula minuta clade members to the genus Cystobasidium. Antonie van Leeuwenhoek, 2015, 107(1): 173-185.

Качалкин А.В., Абдуллабекова Д.А., Магомедова Е.С., Магомедов Г.Г., Чернов И.Ю. Дрожжевые грибы виноградников Дагестана и других регионов. Микробиология. 2015, 84(3): 360-368.

Liu X.-Z., Wang Q.-M., Göker M., Groenewald M., Kachalkin A.V., et al. Towards an integrated phylogenetic classification of the Tremellomycetes. Studies in Mycology. 2015, 81: 85–147.

Качалкин А.В., Глушакова А.М., Панкратов Т.А. Дрожжевое население лишайников полуострова Киндо. Микробиология. 2017, 86(6): 762-769.

Тепеева А.Н., Глушакова А.М., Качалкин А.В. Особенности дрожжевых сообществ почв города Москвы. Микробиология, 2018, 87(3): 303-313.

Kachalkin A.V., Turchetti B., Inácio J., Carvalho C., Mašínová T., et al. Rare and undersampled dimorphic basidiomycetes. Mycological Progress, 2019, 18 (7): 945-971.

Streletskii R.A., Kachalkin A.V., Glushakova A.M., Yurkov A.M., Demin V.V. Yeasts producing zeatin. PeerJ, 2019, 7: e6474.

Maksimova I.A., Glushakova A.M., Thanh V.N., Kachalkin A.V. Yamadazyma cocois f.a., sp. nov., an ascomycetous yeast isolated from coconuts. Int. J. System. Evol. Microbiol. 2020, 70(5): 3491-3496.

Glushakova A.M., Rodionova E.N., Kachalkin A.V. Yeasts in feces of pigeons (Columba livia) in the city of Moscow. Current Microbiology, 2021, 78(1): 238-243.

Kachalkin A.V., Abdullabekova D.A., Magomedova E.S., Yurkov A.M. Zygotorulaspora dagestanica sp. nov., a novel ascomycetous yeast species associated with the Georgian honeysuckle (Lonicera iberica M. Bieb.). Int. J. System. Evol. Microbiol. 2021, 71(4): 004785

(полный список публикаций см. на сайте ВКМ  www.vkm.ru).