Этап 4.

Тема: «Влияние аварийных разливов нефти на микробное разнообразие в поверхностных водах и седиментах Балтийского моря в летний и зимний периоды»

В ходе выполнения проекта по Соглашению о предоставлении субсидии от 24.08.2015г. №14.616.21.0038 с Минобрнауки России в рамках федеральной целевой программы «Исследования и разработки по приоритетным направлениям развития научно-технологического комплекса России на 2014–2020 годы» на этапе №4 в период с 01.01.2017г. по 31.12.2017г. выполнялись следующие работы:

1. Изучение химической структуры биосурфактантов (биоПАВ) у штаммов-деструкторов углеводородов нефти.

2. Испытания биоразлагаемых носителей и сорбентов в модельных экспериментах.
3. Получение экспериментального образца ассоциации микроорганизмов-деструкторов углеводородов нефти как основы биопрепарата для биоремедиации и биоаугментации поверхностных вод и седиментов Балтийского моря.

4. Оптимизация условий культивирования микроорганизмов-деструкторов углеводородов нефти для наибольшего выхода активной биомассы.
5. Участие в мероприятиях, направленных на освещение и популяризацию промежуточных и окончательных результатов научных исследований.
6. Подготовка заявки на патент.

7. Подготовка публикации в научном журнале, индексируемом в базах данных Web of science и Scopus.

8. Получение препаратов геномной ДНК активных штаммов-деструкторов углеводородов нефти.

9. Секвенирование геномов активных штаммов-деструкторов углеводородов нефти.
10. Участие в мероприятиях, направленных на освещение и популяризацию промежуточных и окончательных результатов научных исследований.

11. Изучение экспрессии катаболических генов у выделенных штаммов методами ПЦР в реальном времени.

12. Подготовка публикации в научном журнале, индексируемом в базах данных Web of science и Scopus.

При этом были получены следующие результаты:

1. Краткое описание основных полученных результатов:

На четвертом этапе работы проведено изучение химической структуры биосурфактантов (биоПАВ) у штаммов-деструкторов углеводородов нефти. Подготовлен документ «Перечень химических структур биосурфактантов». Также разработан документ «Перечень маркерных последовательностей ДНК, позволяющих определить присутствие в окружающей среде исследуемых микроорганизмов». Проведены испытания биоразлагаемых носителей и сорбентов в модельных экспериментах. Участники проекта подготовили «Лабораторный регламент получения биоразлагагаемых биосорбентов для использования в биоремедиации и биоаугментации поверхностных вод и седиментов Балтийского моря», «Акт получения экспериментального образца носителя для микроорганизмов-деструкторов углеводородов нефти». Разработан и получен экспериментальный образец ассоциации микроорганизмов-деструкторов углеводородов нефти как основы биопрепарата для биоремедиации и биоаугментации поверхностных вод и седиментов Балтийского моря. Составлены паспорта микроорганизмов-деструкторов углеводородов нефти. Проведена оптимизация условий культивирования микроорганизмов-деструкторов углеводородов нефти для наибольшего выхода активной биомассы. На основе данных работ разработан «Лабораторный регламент на получение и хранение микроорганизмов- деструкторов углеводородов нефти и их ассоциации для использования в биоремедиации и биоаугментации поверхностных вод и седиментов Балтийского моря».

Сотрудники ИБФМ РАН принимали участие в мероприятиях, направленных на освещение и популяризацию промежуточных и окончательных результатов научных исследований. Подготовлена заявка на изобретение на патент РФ «Консорциум микроорганизмов для очистки поверхностных вод и седиментов Балтийского моря от нефти и нефтепродуктов». Сотрудники ИБФМ РАН подготовили 3 публикации в научных журналах, индексируемых в базах данных WEB OF SCIENCE и SCOPUS, а именно, «Биотехнология», «Микробиология» и «Frontiers in Microbiology».

Представителями Института молекулярной и клеточной биологии Университета Тарту было проведено изучение экспрессии катаболических генов у выделенных штаммов методами ПЦР в реальном времени. Также сотрудниками Института молекулярной и клеточной биологии Университета Тарту (Эстония) подготовлена публикация в научном журнале, индексируемом в базах данных Web of science и Scopus.

Сотрудниками Департамента наук об окружающей среде Университета Хельсинки (Финляндия) были получены препараты геномной ДНК активных штаммов-деструкторов углеводородов нефти. Также было проведено секвенирование геномов активных штаммов-деструкторов углеводородов нефти. Подготовлены паспорта микроорганизмов-деструкторов углеводородов нефти. Представители Департамента наук об окружающей среде Университета Хельсинки (Финляндия) участвовали в мероприятиях, направленных на освещение и популяризацию промежуточных и окончательных результатов научных исследований.

По данному проекту поставленные задачи реализованы полностью.

На четвертом этапе работы проведено изучение химической структуры биосурфактантов (биоПАВ) у штаммов-деструкторов углеводородов нефти. Подготовлен документ «Перечень химических структур биосурфактантов». Также разработан документ «Перечень маркерных последовательностей ДНК, позволяющих определить присутствие в окружающей среде исследуемых микроорганизмов». Проведены испытания биоразлагаемых носителей и сорбентов в модельных экспериментах. Участники проекта подготовили «Лабораторный регламент получения биоразлагагаемых биосорбентов для использования в биоремедиации и биоаугментации поверхностных вод и седиментов Балтийского моря», «Акт получения экспериментального образца носителя для микроорганизмов-деструкторов углеводородов нефти». Разработан и получен экспериментальный образец ассоциации микроорганизмов-деструкторов углеводородов нефти как основы биопрепарата для биоремедиации и биоаугментации поверхностных вод и седиментов Балтийского моря. Составлены паспорта микроорганизмов-деструкторов углеводородов нефти. Проведена оптимизация условий культивирования микроорганизмов-деструкторов углеводородов нефти для наибольшего выхода активной биомассы. На основе данных работ разработан «Лабораторный регламент на получение и хранение микроорганизмов- деструкторов углеводородов нефти и их ассоциации для использования в биоремедиации и биоаугментации поверхностных вод и седиментов Балтийского моря».

Сотрудники ИБФМ РАН принимали участие в мероприятиях, направленных на освещение и популяризацию промежуточных и окончательных результатов научных исследований. Подготовлена заявка на изобретение на патент РФ «Консорциум микроорганизмов для очистки поверхностных вод и седиментов Балтийского моря от нефти и нефтепродуктов». Сотрудники ИБФМ РАН подготовили 3 публикации в научных журналах, индексируемых в базах данных WEB OF SCIENCE и SCOPUS, а именно, «Биотехнология», «Микробиология» и «Frontiers in Microbiology».

Представителями Института молекулярной и клеточной биологии Университета Тарту было проведено изучение экспрессии катаболических генов у выделенных штаммов методами ПЦР в реальном времени. Также сотрудниками Института молекулярной и клеточной биологии Университета Тарту (Эстония) подготовлена публикация в научном журнале, индексируемом в базах данных Web of science и Scopus.

Сотрудниками Департамента наук об окружающей среде Университета Хельсинки (Финляндия) были получены препараты геномной ДНК активных штаммов-деструкторов углеводородов нефти. Также было проведено секвенирование геномов активных штаммов-деструкторов углеводородов нефти. Подготовлены паспорта микроорганизмов-деструкторов углеводородов нефти. Представители Департамента наук об окружающей среде Университета Хельсинки (Финляндия) участвовали в мероприятиях, направленных на освещение и популяризацию промежуточных и окончательных результатов научных исследований. По данному проекту поставленные задачи реализованы полностью.

2. Оценка соответствия полученных результатов техническим требованиям к выполняемому проекту и перспектив продолжения работ по проекту.

В соответствии с приложением 1 к Соглашению в рамках выполнения 4 этапа были получены научно-технические результаты, соответствующие требованиям к выполняемому проекту.

В ходе выполнения проекта подготовлены следующие документы:

1. Перечень химических структур биосурфактантов.
2. Акт получения экспериментального образца носителя для микроорганизмов-деструкторов углеводородов нефти.
3. Лабораторный регламент получения биоразлагаемых биосорбентов для использования в биоремедиации и биоаугментации поверхностных вод и седиментов Балтийского моря.
4. Паспорта и свидетельства о депонировании микроорганизмов-деструкторов углеводородов нефти.
5. Заявка на патент и уведомление о ее поступлении в Роспатент.
6. Проект методических рекомендаций по характеристике плазмидного профиля эффективных углеводородокисляющих микроорганизмов.
7. Акт о получении экспериментального образца ассоциации микроорганизмов-деструкторов углеводородов нефти как основы биопрепарата для биоремедиации и биоаугментации поверхностных вод и седиментов Балтийского моря.
8. Перечень структур плазмид и ассоциированных с ними генов, участвующих в горизонтальном переносе генов.
9. Маркерные последовательности ДНК, позволяющие определить присутствие в окружающей среде исследуемых микроорганизмов без необходимости проведения генных модификаций.
10. Лабораторный регламент получения и хранения микроорганизмов-деструкторов углеводородов нефти и их ассоциации для использования в биоремедиации и биоаугментации поверхностных вод и седиментов Балтийского моря.

Комиссия Минобрнауки России признала обязательства по Соглашению на отчетном этапе исполненными надлежащим образом.