Сектор актиномицетов

Рук. Евтушенко Л.И., д.б.н., evtushenko@ibpm.pushchino.ru

Сотрудники сектора

Барышникова Лидия Михайловна, с.н.с., к.б.н.
Дорофеева Любовь Владимировна, с.н.с., к.б.н.
Краузова Валентина Ивановна, н.с., к.б.н.
Таптыкова Светлана Дмитриевна, н.с., к.б.н.
Буева Ольга Вячеславовна, м.н.с.
Автух Александр Николаевич, инж., к.б.н.
Лысанская Валентина Яковлевна, инж.
Присяжная Наталья Викторовна, инж.
Травкина Лидия Савельевна, ст.лаб.
Лабунская Татьяна Валерьевна, ст.лаб.

Основные направления научных исследований  
Научные исследования связаны с изучением таксономического разнообразия актиномицетов и близких организмов и оценкой их биотехнологического потенциала. В фокусе внимания – поиск и описание новых таксонов  актинобактерий, вопросы разграничения филогенетически близких видов на уровне фенотипа и выявление новых хемотаксономических маркеров видов, в т.ч., полимеры клеточной стенки и их компоненты, МАЛДИ масс-спектры.   

Наиболее значимые результаты
Обнаружение и описание 7 новых родов и более 30 новых видов бактерий, в т.ч., ассоциированных с растениями и фитопатогенными нематодами, а также более трех десятков новых структур анионных гликополимеров клеточных стенок актинобактерий. Опубликование в составе наиболее авторитетных международных изданий по микробиологии («The Prokaryotes», «Bergey’s Manual of Systematic Bacteriology») более 15 глав,  содержащих обзор современного состояния области исследований различных групп актинобактерий.

Основные публикации, отражающие направления исследований
DorofeevaL. V., EvtushenkoL. I., KrausovaV. I., KarpovA. V., Subbotin, S. A.,   Tiedje, J. M. Rathayibactercaricis sp. nov. and Rathayibacterfestucae sp. nov., isolated from the phyllosphere of Carex sp. and the leaf gall induced by the nematode Anguinagraminis on Festucarubra L., respectively. Int. J. Syst. Evol. Microbiol. 2002, 52: 1917–1923.
Evtushenko L.I., Dorofeeva L.V., Dobrovolskaya T.G., Streshinskaya G.M., Subbotin S.A., Tiedje J.M. Agreia bicolorata gen. nov., sp. nov., to accommodate actinobacteria isolated from narrow reed grass infected by the nematode Heteroanguina graminophila. Int. J. Syst. Evol. Microbiol.2001, 51: 2073–2079 
Evtushenko L.I., Dorofeeva L.V., Krausova V.I., Gavrish E.Y., Yashina S.G., Takeuchi M. Okibacterium fritillariae gen. nov., sp. nov., a novel genus of the family Microbacteriaceae. Int. J. Syst. Evol. Microbiol.2002, 52: 987–993.  
Evtushenko L.I., Krausova V.I. 2012. Genus Kribbella, рр. 1264-1280. In: Bergey's Manual of Systematic Bacteriology. Vol. 5. Springer, NY, 2012).
Hamada M., Komukai C., Tamura N., Evtushenko L.I., Vinokurova N.G., Suzuki K.-i. Herbiconiux flava sp. nov., and emended description of the genus Herbiconiux. Int. J. Syst. Evol. Microbiol 2012, 62: 795-799
Kroppenstedt R., Evtushenko L. The Family Nocardiopsaceae, pp. 754-795. In: The Prokaryotes. A Handbook on the Biology of Bacteria, V.3. (Eds: M. Dworkin, S. Falkow, E. Rosenberg, K.-H. Schleifer, E.  Stackebrandt), Springer, NY, 2006.
Schumann P., Kampfer P., Busse H-J., Evtushenko L.I. Proposed minimal standards for describing new genera and species of the suborder Micrococcineae. Int. J. Syst. Evol. Microbiol. 2009, 59: 1823-1849.
Shashkov A.S., Ostash B.E., Fedorenko V.A., Streshinskaya G.M., Tul’skaya E.M., Senchenkova S.N., Baryshnikova K.V., Evtushenko L.I. Novel teichulosonic acid from cell wall of Streptomyces coelicolor M145 Carbohydr. Res. 2012, 359: 70–75
Tul'skaya E.M., Streshinskaya G.M., Shashkov A.S., Senchenkova S.N., Avtukh A.N., Baryshnikova L.M., Evtushenko L.I. 2011. Novel teichulosonic acid from cell walls of some representatives of the genus Kribbella. Carbohydr. Res. 2011, 346: 2045-2051.
Трутко С.М., Евтушенко Л.И., Дорофеева Л.В., Шляпников М.П., Гавриш Е.Ю., Сузина Н.Е., Акименко В.К. Терминальные оксидазы представителей различных родов семейства Microbacteriaceae. Микробиология. 2003, 72: 301-307.
Шашков А.С., Cтрешинская Г.М., Козлова Ю.И., Тульская Е.М., Сенченкова С.Н.,  Арбатский Н.П., Буева О.В., Евтушенко Л.И. Тейхулозоновая кислота  – анионный полимер нового класса из клеточной стенки ActinoplanesutahensisВКМ Ас-674Т. Биохимия, 2012, 77: 633-640.

Публикации
Сотрудниками сектора за последние 3 года опубликовано 25 работ, в их числе экспериментальные статьи, обзор и главы в ведущих российских и зарубежных изданиях (список публикаций см. на сайте ВКМ  www.vkm.ru).
Примеры проектов
Программа Президиума РАН «Молекулярная и клеточная биология»
Новые микроорганизмы explantae и их характеристика (особенности химического состава, метаболитов и морфологических структур), 2008-2012 (Программа Президиума РАН «Молекулярная и клеточная биология»).

ФЦП «Исследования и разработки по приоритетным направлениям развития научно-технологического комплекса России на 2007-2013 годы»
Проведение исследований с целью обеспечения гарантированного сохранения генетического разнообразия микроорганизмов с использованием научно-технической базы УСУ “Всероссийская коллекция микроорганизмов”, включающей азотное криогенное хранилище», 2011-2012, Госконтракт № 16.518.11.7035.  
Исследования и мероприятия, направленные на повышение качества фонда и услуг Всероссийской коллекции микроорганизмов (ВКМ) в интересах пользователей, 2007-2008,  Госконтракт № 02.518.11.7092.  
РФФИ
Семейство Nocardioidаceae: новые таксоны, новые диагностические характеристики, гармонизация таксономической структуры (2012-2014)
Эколого-таксономическое изучение актинобактерий из редких и исчезающих видов растений Московской области (РФФИ-р2004наукоград, 2004-2006)
Актиномицеты - возбудители парши картофеля: видовое разнообразие, классификация, идентификация (РФФИ-Бел2004, 2004-2006) 
Новые таксоны мицелиальных актиномицетов (2003-2005)
Актиномицеты микробных сообществ, ассоциированных с фитопатогенными галловыми нематодами (2000-2002).
Переносчики дыхательной цепи, природа пигментов и путь биосинтеза изопреноидных соединений как новые хемотаксономические маркеры родов и видов коринеформных актинобактерий (2002-2004, рук. Трутко С.М., ИБФМ РАН)
Структура анионных углеводсодержащих полимеров клеточных стенок как критерий границ видов рода Strерtотусеs (2001-2003, рук. Стрешинская Г.М., Биологический факультет МГУ им. М.В.Ломоносова)
ИНТАС
Первичная структура тейхоевых кислот и других анионных полимеров клеточных стенок как хемотаксономические маркеры видов актиномицетов (ИНТАС 01-2040, 2002-2005).

Тейхоевые кислоты клеточных стенок как хемотаксономические маркеры таксонов актиномицетов (ИНТАС 97-1571, 1998-2000).


142290 Московская область, г.Пущино, пр-т Науки, д.5, Тел./факс: (495)956-33-70, boronin@ibpm.pushchino.ru; rta@ibpm.pushchino.ru; www.ibpm.ru


Разработка сайта - Alces