Сектор информации и координации

Ступарь О.С

 

Рук. сектора к.б.н. Ступарь О.С.,  stupar@ibpm.pushchino.ru

Работает в ИБФМ РАН с 1978 года после окончания Биологического факультета Днепропетровского государственного университета. Член Исполкома Всемирной федерации коллекций культур (WFCC).

Сотрудники сектора
Калакуцкий Лев Владимирович, чл.-корр. РАН,  Советник РАН, klv@dol.ru
Василенко Александр Николаевич, IT-специалист, vanvkm@gmail.com
Соколов Александр Павлович, с.н.с., к.б.н., sokolov@ibpm.pushchino.ru
Иванова Ираида Васильевна, секретарь, vkm@pushchino.ru

Направления деятельности сектора
Информационная и научно-организационная деятельность связана с решением задач по  созданию на базе ВКМ Биологического ресурсного центра мирового уровня. В числе основных задач последних лет – повышение качества и уровня информационного сопровождения штаммов фонда ВКМ, создание и поддержание информационных ресурсов ВКМ и их интеграция с существующими и разрабатываемыми базами данных и сетями Биологических ресурсных центров мира, в их числе StrainInfo, WDCM, MycoBank и др.
Сотрудники сектора входят в группу разработчиков единой мировой информационной системы Биологических ресурсных центров и являются ключевыми исполнителями 2-х проектов 7-й Рамочной программы ЕС  по данной тематике.

1

2

Видеоконференция «Брюссель-Пущино».
Обсуждение задач
Рабочей группы 8
в рамках Проекта MIRRI.

Участники конференции
от ВКМ:  О.С. Ступарь,
Л.В. Калакуцкий, А.Н. Василенко

Важными направлениями деятельности сектора являются также подготовка и публикация научно-аналитических обзоров, выступления с докладами и обсуждения на релевантных площадках (научных конференциях, специальных заседаниях круглых столов, комиссий и комитетов Общественной палаты РФ, Думы РФ, в СМИ) проблем, касающихся состояния биологических коллекций в стране, совершенствования законодательной базы РФ по вопросам прав собственности на национальные генетические ресурсы и прав их управления.  
Цель обсуждений и предложений – инициация деятельности по созданию в России Биологических ресурсных центров мирового уровня и достижение ясности в вопросах взаимоотношений ведомств и организаций, причастных к сохранению генетических ресурсов РФ и регулированию их оборота (делегирование/переуступка прав собственности, владения, пользования, распоряжения и т.д.).

Основные публикации
Калакуцкий Л.В. Доступ к генетическим ресурсам. Вестник Российской Академии наук. 2001, 71 (5): 396-404.
Калакуцкий Л.В. Коллекции культур: от неустойчивого существования к устойчивому развитию. Cтр. 113-118.  Сб. «Вопросы правового обеспечения научно-технической и инновационной деятельности». Информационно-аналитический сборник по материалам выездного расширенного заседания и «круглого стола» ГД. М.: Издание Государственной Думы, 2011.
Калакуцкий Л.В. Коллекции микробов. Cтр. 39-47.  Сб. «Сохранение биологического разнообразия России - основа устойчивого развития науки и наукоемких производств". Материалы докладов на Слушаниях Общественной палаты РФ. М.: ГНУ ВСТИСП Россельхозакадемии, 2011.
Калакуцкий Л.В., Озерская С.М., Евтушенко Л.И., Мазанов А.Л. Российские коллекции Микроорганизмов. Прикладная биохимия и микробиология. 1996, 32(1): 144-154.
Калакуцкий Л.В., Озерская С.М. Биологические ресурсные центры: современное состояние в России и мире, проблемы организации, перспективы развития. Вестник биотехнологии и физико-химической биологии им. Ю.А.Овчинникова. 2011, 7 (1): 28-40.
Ozerskaya S.M., Kirillova N.P., Vasilenko A.N. FungalDC: a database on fungal diversity in genetic resource collections. IMA Fungus. 2012, 3(1):  9.
Vasilenko A., Ozerskaya S., Stupar O. Current WFCC CC catalogues as a starting ground for networking Efforts. WFCC Newsletter. 2011, 50: 5-15.
Vasilenko A.N., Ozerskaya S.M. Fungal taxonomic diversity and bioinformatics-related issues, рр. 633-634. Proceedings of the 6th Int. Conf. on Bioinformatics and Biomedical Engineering (iCBBE 2012). 2012, N-Y: IEEE Service Center.
Vasilenko A.N., Ozerskaya S.M. Package for сluster analysis on an IBM PC Computer. BINARY. 1992, 4: 64-65.
Vasilenko A.N., Ozerskaya S.M. Quick algorithms of cluster analysis in BIOMATRIX 3.0. BINARY. 1994, 6: 141-144.

Свидетельства о Государственной регистрации программ и баз данных
Василенко А.Н., Озерская С.М., Ступарь О.С., Кочкина Г. А., Иванушкина Н.Е., Карпышева Н.Н., Кириллова Н.П., Растегаева Т.Ф. Программа: Программный комплекс генерации таблиц Каталога мицелиальных грибов ВКМ и страниц поисковой системы на сайте ВКМ ИБФМ РАН. Свидетельство о государственной регистрации программы для ЭВМ № 2011613007 (14.04.2011).
Василенко А.Н.  Озерская С.М., Кочкина Г. А. и др.  Программный комплекс генерации таблиц по срокам сохранения жизнеспособности мицелиальных грибов ВКМ и страниц поисковой системы на сайте ВКМ ИБФМ РАН. Свидетельство о госрегистрации программы для ЭВМ № 2012619049 (05.10.2012).
Озерская С.М., Иванушкина Н.Е., Василенко А.Н. и др. База данных: Методы и максимальные сроки сохранения жизнеспособности мицелиальных грибов Всероссийской коллекции микроорганизмов ИБФМ РАН. Свидетельство о государственной регистрации базы данных №20120621040 (05.10.2012).

Участие в выполнении в выполнении проектов

ФЦП «Исследования и разработки по приоритетным направлениям развития научно-технологического комплекса России на 2007-2013 годы»
Таксономические исследования, развитие информационных ресурсов и научно-организационные мероприятия, направленные на повышение качества фонда и услуг Всероссийской коллекции микроорганизмов в интересах пользователей, 2012-2013. Госконтракт № 14.518.11.7069.
Проведение исследований с целью обеспечения гарантированного сохранения генетического разнообразия микроорганизмов с использованием научно-технической базы УСУ “Всероссийская коллекция микроорганизмов”, включающей азотное криогенное хранилище», 2011-2012, Госконтракт № 16.518.11.7035.  
Исследования и мероприятия, направленные на повышение качества фонда и услуг Всероссийской коллекции микроорганизмов (ВКМ) в интересах пользователей, 2007-2008,  Госконтракт № 02.518.11.7092.

7-я Рамочная Программа научных исследований Евросоюза
Инфраструктура исследований микробных ресурсов (Microbial Resource Research Infrastructure – MIRRI), 2012-2015.
Создание банков данных по ризосферным микроорганизмам (Banking Rhizosphere Micro-Organisms – BRIO), 2011-2014. (http://cordis.europa.eu/projects/rcn/98780_en.html)

ФЦНТП «Исследования и разработки по приоритетным направлениям развития науки и техники на 2002-2006 годы»
Научно-методическое,  организационное и материально-техническое обеспечение функционирования уникального стенда «Всероссийская коллекция микроорганизмов (ВКМ)» для проведения научно-исследовательских, опытно-конструкторских и технологических работ по приоритетным направлениям программы, 2006 (направление «Развитие инфраструктуры»). Госконтракт № 02.452.11.7019).
Таксономическое изучение микроорганизмов с использованием современных методов и подходов на установке «Всероссийская коллекция микроорганизмов» (ВКМ), 2005 (направление «Развитие инфраструктуры»). Госконтракт №02.452.12.7112.   
Научно-образовательная деятельность Всероссийской коллекции микроорганизмов как базы профессиональной подготовки микробиологов Пущинского госуниверситета, 2005-2006. (Направл. «Развитие инфраструктуры научно-технической и инновационной деятельности высшей школы и ее кадрового потенциала», 2005 г.)
Формирование Всероссийской коллекции микроорганизмов (ВКМ). Создание и поддержание в нарастающем объеме фонда культур ВКМ, обеспечение заинтересованных учреждений аутентичными культурами актиномицетов, бактерий, мицелиальных грибов и дрожжей и информацией о них, 2004. № Госрегистрации 0120.0.403403, 2004 г.)

РФФИ
«Микроб» - интегрированная база данных по микроорганизмам, 1999-2001, рук. Л.В. Калакуцкий.

Создание информационной системы по номенклатуре и таксономии микроорганизмов,  1996-1998, рук. Л.В. Калакуцкий.


142290 Московская область, г.Пущино, пр-т Науки, д.5, Тел./факс: (495)956-33-70, boronin@ibpm.pushchino.ru; rta@ibpm.pushchino.ru; www.ibpm.ru


Разработка сайта - Alces