Лаборатория радиоактивных изотопов

Лаборатория организована в 1970 г.

Заведующий лабораторией –  д.б.н., профессор Троценко Юрий Александрович

trotsenko@ibpm.pushchino.ru

Троценко Юрий Александрович

Работает в ИБФМ РАН с 1968 года.
В 1963 году окончил Уральский государственный университет им. А.М. Горького на кафедре  физиологии и биохимии растений. В 1964 г. поступил в аспирантуру при Биолого-почвенном факультете МГУ им. М.В. Ломоносова. После защиты кандидатской диссертации (1969 г.) возглавил лабораторию радиоактивных изотопов.
Область научных интересов – экофизиология, таксономия, биохимия и биотехнология аэробных метилотрофов.
Автор 7 книг монографий, более 360 научных статей, а также 12 изобретений, лауреат премий имени Д.К. Заболотного Президиума АН Украины (1982 г.), имени С.Н. Виноградского Президиума РАН (2009 г.), а также международной академической издательской компании «Наука/Интерпериодика» за лучшие публикации в журналах РАН (1997, 2009, 2010 гг.), в том числе Главной премии (2011 г.).
Под руководством Ю.А. Троценко защищены 2 докторских, 29 кандидатских диссертаций. Д.б.н. проф. Троценко Ю.А. – член редколлегии журналов «Микробиология» и «Прикладная биохимия и микробиология».

Сотрудники лаборатории:

Троценко Юрий Александрович - д.б.н., профессор, зав. лабораторией

Доронина Нина Васильевна - д.б.н., ведущий научный сотрудник

Хмеленина Валентина Николаевна - д.б.н., ведущий научный сотрудник

Ежов Владимир Александрович - к.т.н., старший научный сотрудник

Решетников Александр Сергеевич - к.б.н., старший научный сотрудник

Капаруллина Елена Николаевна - к.б.н., старший научный сотрудник

Торгонская Мария Леонидовна - к.б.н., старший научный сотрудник

Бесчастный Александр Павлович - к.б.н., научный сотрудник

Фирсова Юлия Евгеньевна - к.б.н., научный сотрудник

Мустахимов Ильдар Ильдусович - к.б.н., научный сотрудник

Федоров Дмитрий Николаевич - к.б.н., научный сотрудник

Розова Ольга Николаевна - к.б.н., и.о. научного сотрудника

Бут Сергей Юрьевич - инженер

Ушакова Галина Викторовна - старший лаборант

Лапшина Ирина Анатольевна - старший лаборант

Порошина Мария Николаевна - аспирант

Екимова Галина Александровна - аспирант

Агафонова Надежда Валериевна - магистрант

Замахаева Светлана Андреевна -магистрант

Лаборатория радиоактивных изотопов

Область научных исследований  - изучение биоразнообразия и физиолого-биохимических особенностей метилотрофных бактерий, использующих в качестве источников углерода и энергии восстановленные С1-соединения: метан, метанол, метилированные амины, галометаны и др.
Основные направления работы:

  • Расширение, поддержание коллекции охарактеризованных аэробных метилотрофных бактерий и исследование их биотехнологического потенциала
  • Изучение организации и регуляции специфического метаболизма метилотрофов
  • Изучение физиолого-биохимических основ метилотрофного фитосимбиоза
  • Исследование молекулярно-биохимических механизмов дегалогенирования дихлорметана
  • Исследование механизмов осмо- и термоадаптации галоалкалофильных и термофильных метилотрофов.

Основные достижения:
Основополагающие исследования лаборатории создали современные представления о таксономическом и структурно-функциональном разнообразии, повсеместном распространении и глобальной биогеохимической роли аэробных метилотрофов, способствуют эффективной реализации их биотехнологического потенциала.

  • Создана и поддерживается отечественная коллекция метилотрофных бактерий и дрожжей (600 штаммов), которая является наиболее представительной и охарактеризованной в мире. Предложено и валидировано 10 новых родов и более 50 новых видов.
  • Впервые создана коллекция, включающая 7 новых родов и 26 видов аэробных метилотрофных бактерий, устойчивых к экстремальным значениям рН (>9), солености (до 15% NaCl) и температуры (>60°С).
  • С использованием биохимических и молекулярно-биологических методов расшифрованы уникальные пути углеродного, азотного и фосфорного метаболизма, особенности их организации  и регуляции у метилотрофных бактерий и дрожжей, предложен новый вариант РМФ-пути первичной ассимиляции углерода у метанотрофов с участием пирофосфат-зависимой 6-фосфофруктокиназы.
  • В рамках совместных проектов с фирмой Genoscope проводится анализ полных нуклеотидных последовательностей геномов метанотрофов Methylomicrobium alcaliphilum 20Z,Methylomicrobium buryatense 5G, термофильного Methylocaldum szegediense О-12 и метилобактерии Methyloversatilis thermotolerans 3t, изучение молекулярных основ метилотрофии методами геномики и протеомики.
  • Обнаружены специфические цитобиохимические механизмы термо- и осмоадаптации недавно выделенных экстремофильных метилотрофных бактерий: образование защитных паракристаллических гликопротеиновых структур на поверхности клеток, сверхсинтез органических термо- и осмопротекторов, важнейшими из которых являются эктоин, глутамат и сахароза.
  • Расшифрованы нуклеотидные последовательности генов синтеза эктоина и сахарозы у галофильных/толерантных метилотрофов. Обнаружены транскрипционный белок-регулятор EctRи два промотора, контролирующие синтез эктоина в зависимости от осмолярности среды. Проведенная расшифровка нуклеотидных последовательностей генов и организации структуры эктоинового кластера создала реальные предпосылки получения эктоина путем целенаправленного генно-инженерного конструирования новых эффективнях штаммов-продуцентов на основе непищевого сырья метана и метанола.
  • Получены приоритетные данные о способности аэробных метилотрофов-фитосимбионтов синтезировать широкий спектр биоактивных соединений фитогормонов (цитокинины, ауксины, витамины), значительно ускоряющих рост, развитие и регенерацию гнотобиотических растений, что может найти практическое применение в биотехнологии растений. Ведется разработка препарата стимулятора роста растений «Метилобактерин», предназначенного для широкого использования в сельском хозяйстве.
  • Получены данные о важной роли внутриклеточного рН-гомеостаза в метаболизме метилобактерий-деструкторов дихлорметана, а также исключительном значении ДНК репарации для снижения алкилирующего действия на ДНК промежуточного продукта дегалогенирования дихлорметана - S-хлорметилглутатиона. Методами общей и молекулярной микробиологии изучаются гены и ферменты метаболизма галометанов, исследуются особенности транспорта образующихся ионов хлора и поддержания рН-гомеостаза, оцениваются распространение генов биодеградации галометанов среди прокариот и эукариот, что позволит оценить метаболический потенциал и эволюцию биодеструкторов галометанов, а также разработать методологию создания новых активных штаммов, разлагающих эти экологически опасные поллютанты.
  • Разработаны и успешно испытаны новые технологические регламенты получения широкого спектра продуктов микробного биосинтеза из метана и метанола (ферменты, биостабилизаторы, биоразлагаемые (со)полимеры бутирата и валерата, экзополисахариды), а также перспективные способы биодеградации ряда высокотоксичных алифатических соединений (метанол, метилированные амины, формальдегид, моно- и дихлорметан, метил- и этилацетат, этилендиаминтетраацетат).

Исследование коллективом лаборатории молекулярных основ метилотрофии и экстремофилии методами геномики и протеомики призвано открыть новые возможности практического применения аэробных метилотрофов.

Образовательная деятельность
В лаборатории подготовлены и защищены 3 докторских, 30 кандидатских и 26 магистерских диссертаций, прошли стажировку и выполнили курсовые и дипломные работы более ста студентов различных вузов нашей страны, ближнего и дальнего зарубежья. Коллективом лаборатории издано 5 монографий (1978 г., 1986 г., 2008, 2010, 2011 г.) и 2 учебно-методических пособия (2009, 2012 г.). Сотрудники лаборатории читают авторские курсы лекций в рамках магистерской образовательной программы «Микробиология и вирусология» Пущинского государственного естественно-научного института (ранее ПущГУ).

Проекты

Участие в выполнении проектов, программ и договоров в 2003-2013 гг.:

  • Грант РФФИ № 01-04-48511-а «Аэробные метилотрофные бактерии экстремальных экосистем: механизмы адаптации и выживания» (2001-2003 гг.);
  • Грант РФФИ № 01-04-48513-а «Структурно-функциональная организация и регуляция метаболизма галометанов у аэробных метилотрофов» (2001-2003 гг.);
  • Грант U.S. Civilian Research & Development Foundation (CRDF) RB1-2509-MO-03 “Biodiversity of Methanotrophs in Various Soda Lakes” (2003-2005 гг.);
  • Грант U.S. Civilian Research & Development Foundation (CRDF) IPP GAP CRDF RBO-10305-MO-OO (INEEL) «Aerobic methylotrophic bacteria producing ectoine» (2003-2005 гг.);
  • Грант РФФИ № 03-04-49166-а «Структурно-функциональные основы взаимодействия аэробных метилотрофных бактерий с растениями» (2003-2005 гг.);
  • Грант РФФИ № 04-04-49284-а «Особенности организации и регуляции метаболизма галометанов у различных аэробных метилобактерий» (2004-2006 гг.);
  • Грант РФФИ № 05-04-49515-а «Термофильные и термотолерантные облигатные метанотрофы: биоразнообразие, филогения, механизмы адаптации и выживания». (2005-2007 гг.);
  • 2.1.1.2671 «Аэробные метилотрофные бактерии экстремальных экосистем» (2006-2008 гг.);
  • Совместный российско-французский грант РФФИ № 06-04-22000-НЦНИ_а «Микробная адаптация к хлорированным метанам и молекулярные механизмы деградации» (2006-2008 гг.);
  • Грант РФФИ № 06-04-49498-а «Биоразнообразие, филогения и механизмы осмоадаптации умеренно галофильных аэробных метилобактерий» (2006-2008 гг.);
  • Грант РФФИ № 06-04-49580-а «Молекулярные и физиологические закономерности деградации ЭДТА бактериальным штаммом - облигатным ЭДТА-деструктором» (2006-2008 гг.) (совместно с И.Г. Минкевичем);
  • Государственный контракт № 02.513.11.3087 от 20 марта 2007 г. в рамках федеральной целевой программы «Исследования и разработки по приоритетным направлениям развития научно-технологического комплекса России на 2007 - 2012 годы» по теме «Новые нанонаполненные биосовместимые и биодеградируемые макромолекулярные материалы медицинского назначения» (2007 г.) (совместно с Институтом нефтехимического синтеза им. А. В. Топчиева РАН и РХТУ им. Д.И. Менделеева);
  • Грант РФФИ № 07-04-10171-к «Организация и проведение экспедиции по термальным источникам Кальдеры Узон (Камчатка) для изучения разнообразия термофильных метанотрофов» (2007 г.);
  • Грант РФФИ № 07-04-01064-а «Регуляция биосинтеза эктоина у галоалкалофильных аэробных метанотрофов» (2007-2009 гг.);
  • Грант РФФИ № 07-04-12053-офи «Биосинтез универсального биопротектора эктоина из метанола аэробными метилобактериями» (2007-2008 гг.);
  • Грант РФФИ № 07-04-13559-офи_ц «Колонизация аэробными метилотрофными бактериями растений, выращиваемых в прототипе космической оранжереи для условий микрогравитации» (2007-2008 гг.);
  • Грант РФФИ № 08-04-01484-а «Пирофосфат-зависимые 6-фосфофруктокиназы метанотрофных бактерий: свойства, метаболическая роль и филогения» (2008-2010 гг.);
  • Грант РФФИ № 08-04-01732-а «Структурно-функциональные характеристики поверхностных S-слоев галоалкалофильных метанотрофов: белки, гены и функции» (2008-2010 гг.);
  • Грант РФФИ № 09-04-90450-Укр_ф_а «Термофильные и психрофильные аэробные метилотрофные бактерии: экофизиология, адаптация и филогения» (2009-2010 гг.);
  • Грант РФФИ № 09-04-92520-ИК_а «Аэробные метилотрофные сообщества соленых экосистем: структура, активность и динамика» (2009-2010 гг.);
  • Грант Федерального агентства по образованию Минобрнауки России РНП №2.1.1/605 «Структурно-функциональное и филогенетическое разнообразие аэробных метилотрофных бактерий» в рамках аналитической ведомственной  целевой программы «Развитие научного потенциала высшей школы (2009-2011 годы)» (2009-2011 гг.);
  • Грант У.М.Н.И.К. Фонда содействия развитию малых форм предприятий в научно-технической сфере по теме «Аэробные метилотрофные бактерии-фитосимбионты, стимуляторы роста и развития растений», Госконтракт №6369р/8866 от 2009 г. (2009-2011 гг.);
  • Грант У.М.Н.И.К. Фонда содействия развитию малых форм предприятий в научно-технической сфере по теме «Выделение, идентификация, скрининг и оптимизация условий культивирования аэробных метилобактерий - продуцентов биопротектора эктоина из метанола», Госконтракт №100021р/16819 от 2011 г. (2011-2012 гг.);
  • Грант У.М.Н.И.К. Фонда содействия развитию малых форм предприятий в научно-технической сфере по теме «Биосинтез эктоина метилотрофными бактериями из метанола: создание штамма Methylomicrobium alcaliphilum 20Z, мутантного по гену транскрипционного репрессора ectR, с целью увеличения синтеза эктоина», Госконтракт № 8696р/13164 от 14 января 2011 г. (2011-2012 гг.);
  • Государственный контракт № 16.740.11.0615 от 31 мая 2011 г. и Дополнение от 23 марта 2012 г. № 1 по теме «Биосинтез эктоина галофильными аэробными метилотрофными бактериями» в рамках федеральной целевой программы «Научные и научно-педагогические кадры инновационной России» на 2009-2013 годы, в рамках реализации мероприятия № 1.3.1 Проведение научных исследований молодыми учеными – кандидатами наук;
  • Государственный контракт 14.740.11.0111 от 8 сентября 2010 г. в рамках федеральной целевой программы «Научные и научно-педагогические кадры инновационной России» на 2009-2013 годы по теме «Аэробные метилотрофные бактерии как агенты биосинтеза биосовместимых и биодеградабельных пластиков, ферментных препаратов, стимуляторов роста растений и биосенсорных аналитических систем» (2010-2012 гг.);
  • Грант У.М.Н.И.К. Фонда содействия развитию малых форм предприятий в научно-технической сфере по теме «Выделение, идентификация, скрининг и оптимизация условий культивирования аэробных метилобактерий - продуцентов биопротектора эктоина из метанола» (2011-2012 гг.);
  • Грант У.М.Н.И.К. Фонда содействия развитию малых форм предприятий в научно-технической сфере по теме «Биосинтез эктоина метилотрофными бактериями из метанола: создание штамма Methylomicrobium alcaliphilum 20Z, мутантного по гену транскрипционного репрессора ectR, с целью увеличения синтеза эктоина» (2011-2012 гг.);
  • Государственный контракт 16.512.11.2024 в рамках федеральной целевой программы «Исследования и разработки по приоритетным направлениям развития научно-технологического комплекса России на 2007-2012 годы»  по теме «Разработка методов получения биокатализаторов и повышение эффективности их функционирования для очистки газо-воздушных выбросов промышленных предприятий, содержащих дихлорметан» (2011-2012 гг.) (совместно с ООО «Институт системной биологии СПб Московское отделение» и ИНБИ РАН);
  • Грант РФФИ № 10-04-01224-а «Функциональная геномика галоалкалофильного аэробного метанотрофа Methylomicrobium alcaliphilum» (2010-2012 гг.)
  • Грант РФФИ № 10-04-00808-а «Молекулярно-биохимические механизмы и биоразнообразие фитосимбиоза аэробных метилобактерий» (2010-2012 гг.);
  • Грант РФФИ № 11-04-97544-р_центр_а «Ферменты первичного метаболизма С1-соединений аэробных метилотрофных бактерий: структурно-функциональные и биоаналитические аспекты» (2011-2012 гг.) (совместно с ТулГУ);
  • Грант РФФИ № 11-04-00801-а «Биохимические и генетические аспекты биосинтеза и деградации эктоина у галофильных аэробных метилотрофов» (2011-2013 гг.);
  • Грант РФФИ № 12-04-00760-а «Молекулярно-биохимические механизмы адаптации аэробных метилобактерий к биодеградации дихлорметана» (2012-2014 гг.);
  • Грант РФФИ № 12-04-31373-мол_а «Аэробные метилобактерии фитосимбионты: биоразнообразие и биохимические основы стимуляции роста растений» (2012-2013 гг.);
  • Грант РФФИ № 12-04-32122-мол_а «Гены и ферменты гликолиза у аэробных метанотрофных бактерий: структурно-функциональные особенности и филогения» (2012-2013 гг.).
  • Грант РФФИ № 13-04-01520-а «Молекулярные основы организации и регуляции синтеза биодеградабельного полимера гидроксибутирата (ПГБ) у аэробных метилотрофных бактерий» (2013-2015 гг.);
  • Грант РФФИ № 13-04-01119-а «Гены и ферменты метаболизма сахарозы у аэробных метилотрофных бактерий» (2013-2015 гг.).

 
Награды и премии

Награды и премии коллектива лаборатории:
Диплом участника 8-й Международной специализированной выставки «Мир биотехнологии – 2010» (15–17 марта 2010 г., Москва)
Диплом участника Российской национальной выставки (11–15 июня 2010 г., Париж).
Диплом участника юбилейного Х Московского международного салона инноваций и инвестиций (7-10 сентября 2010 г., Москва).
Диплом участника Международной выставки-презентации «Подмосковье–2010» (23-25 сентября 2010 г., Москва).

д.б.н. проф. Троценко Ю.А

  • Премия Академии Наук Украины им. Д.К. Заболотного (1982 г.);
  • Медаль «За трудовое отличие» (серия К № 378365 от 20 августа 1986 года);
  • Диплом стипендиата Джорджа Сороса победителю конкурса по проблеме «Биоразнообразие» 1993-1994 годов.
  • Медаль «В память 850-летия Москвы» (серия А № 0776356 от 26 февраля 1997 года);
  • Премия Российской Академии Наук им. С.Н. Виноградского за цикл работ «Экстремофильные аэробные метилотрофные бактерии» (Постановление от 8 сентября 2009 г., Диплом № 1761).
  • Премия «Международной академической издательской компании «Наука» за лучшую публикацию в журналах за 1997 год (Диплом № 35, 36 от 26 марта 1998 года);
  • Премия Международной академической издательской компании «Наука/ Интерпериодика» за лучшую публикацию в журналах РАН за 2008 г. (Диплом № 10 от 24 ноября 2009 года);
  • Премия Международной академической издательской компании «Наука/ Интерпериодика» за лучшую публикацию в журналах РАН за 2009 г.;
  • Главная Премия Международной академической издательской компании «Наука/ Интерпериодика» за лучшую публикацию в журналах РАН за 2010 г.

д.б.н., в.н.с. Доронина Н.В.

  • Премия «Международной академической издательской компании «Наука» за лучшую публикацию в журналах за 1997 год (Диплом № 35, 36 от 26 марта 1998 года);
  • Премия американского общества микробиологов им. Моррисон-Рогозы (2005 г.);
  • Премия Международной академической издательской компании «Наука/ Интерпериодика» за лучшую публикацию в журналах РАН за 2008 г. (Диплом № 10 от 24 ноября 2009 года);
  • Премия Международной академической издательской компании «Наука/ Интерпериодика» за лучшую публикацию в журналах РАН за 2009 г.

д.б.н., в.н.с. Хмеленина В.Н.

  • Премия «Международной академической издательской компании «Наука» за лучшую публикацию в журналах за 1997 год (Диплом № 35, 36 от 26 марта 1998 года);
  • Премия американского общества микробиологов  им. Моррисон-Рогозы (2009 г.);
  • Премия Международной академической издательской компании «Наука/ Интерпериодика» за лучшую публикацию в журналах РАН за 2008 г. (Диплом № 10 от 24 ноября 2009 года);
  • Главная Премия Международной академической издательской компании «Наука/ Интерпериодика» за лучшую публикацию в журналах РАН за 2010 г.

к.т.н., с.н.с. Ежов В.А.

  • Юбилейная медаль «За доблестный труд в ознаменование 100-летия со дня рождения Владимира Ильича Ленина» от 14 апреля 1970 года;
  • Медаль «За трудовую доблесть» серия З № 983879 от 25 июня 1981 года;
  • Премия Совета Министров СССР за разработку способов и технологии получения ферментных препаратов № 00596 от 18 апреля 1981 года
  • Орден «Знак Почета» №1550741 от 20 августа 1986 года.

к.б.н., с.н.с. Решетников А.С.

  • Премия Международной академической издательской компании «Наука/ Интерпериодика» за лучшую публикацию в журналах РАН за 2008 г. (Диплом № 10 от 24 ноября 2009 года)
  • Главная Премия Международной академической издательской компании «Наука/ Интерпериодика» за лучшую публикацию в журналах РАН за 2010 г.

к.б.н., с.н.с. Капаруллина Е.Н.

  • Грамота 10-й Пущинской школы-конференции молодых ученых «Биология – Наука XXI века», посвященной 50-летию Пущинского Научного Центра РАН за лучший устный доклад  на секции «Биология и экология микроорганизмов» (2006 год);
  • Премия им. Г.К. Скрябина для молодых ученых ИБФМ РАН по специальности «микробиология» (2006 г.);
  • Грант Губернатора Московской области (2007 г.);
  • Диплом лауреата конкурса, проводимого в рамках российской школы-конференции молодых ученых «Экотоксикология: современные биоаналитические системы, методы и технологии»;
  • Благодарственное письмо Главы города Пущино Московской области за 3 место в городском конкурсе работ молодых ученых 2009 г., посвященном празднику «День труда» (2009 г.).

к.б.н., с.н.с. Торгонская М.Л.

  • Премия Международной академической издательской компании «Наука/ Интерпериодика» за лучшую публикацию в журналах РАН за 2009 г.

к.б.н., н.с. Бесчастный А.П.

  • Премия Международной академической издательской компании «Наука/ Интерпериодика» за лучшую публикацию в журналах РАН за 2008 г. (Диплом № 10 от 24 ноября 2009 года)

к.б.н., н.с. Фирсова Ю.Е.

  • Премия Международной академической издательской компании «Наука/ Интерпериодика» за лучшую публикацию в журналах РАН за 2009 г.

к.б.н., н.с. Мустахимов И.И.

  • Главная Премия Международной академической издательской компании «Наука/ Интерпериодика» за лучшую публикацию в журналах РАН за 2010 г.

к.б.н., н.с. Федоров Д.Н.

  • Премия Международной академической издательской компании «Наука/ Интерпериодика» за лучшую публикацию в журналах РАН за 2008 г. (Диплом № 10 от 24 ноября 2009 года);
  • Победитель Программы «Участник молодежного научно-инновационного конкурса 2008» («УМНИК») Госконтракт № 8866;
  • Диплом 14-й Международной Пущинской школы-конференции молодых ученых за лучший устный доклад на секции «Биология и экология микроорганизмов» (2010 г.).

к.б.н., и.о.н.с. Розова О.Н.

  • Грант Губернатора Московской области (2007 г.);
  • Премия Международной академической издательской компании «Наука/ Интерпериодика» за лучшую публикацию в журналах РАН за 2008 г. (Диплом № 10 от 24 ноября 2009 года);
  • Победитель Программы «Участник молодежного научно-инновационного конкурса 2010» («УМНИК») Госконтракт № 8696р/13164.

асп. Порошина М.Н.

  • Победитель Программы «Участник молодежного научно-инновационного конкурса 2010» («УМНИК») Госконтракт № 100021р6819.

 
Публикации

Список публикаций коллектива лаборатории за 2003-2013 гг.:
Книги:

  • Троценко Ю.А., Хмеленина В.Н. Экстремофильные метанотрофы / Отв. ред.: В.Ф. Гальченко // Пущино: ОНТИ ПНЦ РАН. 2008. 205 с.
  • Троценко Ю.А., Доронина Н.В., Хмеленина В.Н., Понаморева О.Н. Биология и биотехнология аэробных метилотрофов / Учебно-методическое пособие // Тула: Изд-во ТулГУ. 2009. 204 с.
  • Троценко Ю.А., Доронина Н.В., Торгонская М.Л. Аэробные метилобактерии // Пущино: ОНТИ ПНЦ РАН. 2010. 325 с.
  • Троценко Ю.А., Торгонская М.Л. Метилотрофные дрожжи // Москва: "ТР-принт". 2011. 313 с.
  • TrotsenkoY.A., StepniewskaZ. Biologia i biotechnologia aerobowych methylotrofow // Katolicki Uniwersytet Lubelski Jana Pawla II, Widzial Matematichno-Przyrodniczy. Lublin: Wydawnictwo KUL, 2012. 172 p.

Патенты:

  • Решетилов А.Н., Кувичкина Т.Н., Капаруллина Е.Н., Доронина Н.В. «Биосенсор для определения этилендиаминтетрауксусной кислоты и ее комплексов с ионами металлов». Патент РФ № 105292, 2011 год.
  • Решетилов А.Н., Плеханова Ю.В., Доронина Н.В. «Биосенсор для определения дихлорметана» Патент РФ №107790, 2011 год.

Решетилов А.Н., Плеханова Ю.В., Доронина Н.В. «Биосенсор для определения дихлорметана». Патент РФ № 107156, 2011 год.

Статьи:

  • Зякун А.М., Доронина Н.В., Захарченко В.Н., Троценко Ю.А. Фракционирование изотопов хлора аэробными метилотрофными бактериями Methylobacteriumdichloromethanicumпри росте на дихлорметане // Микробиология. 2003. Т. 72. №3. С. 390-394.
  • Doronina N.V., Darmaeva T.D., Trotsenko Y.A. Methylophaga alcalica sp. nov., a novel alkaliphilic and moderately halophilic, obligately methylotrophic bacterium from the East Mongolian saline soda lake // Int. J. Syst. Evol. Microbiol. 2003. V. 53. № 1. P. 223-229.
  • Doronina N.V., Trotsenko Y.A. Reclassification of ‘Blastobacter viscosus 7d’ and ‘Blastobacter aminooxidans 14a’ as Xanthobacter viscosus sp. nov. and Xanthobacter aminooxidans sp. nov. // Int. J. Syst. Evol. Microbiol. 2003. V 53. №1. P. 179-182.
  • КаляеваМ.А., ИвановаЕ.Г., ДоронинаН.В., ЗахарченкоН.С., ТроценкоЮ.А., БурьяновЯ.И. Стимуляция метанотрофными бактериями морфогенеза пшеницы in vitro // Докл. АН. 2003. Т. 388. №6. С. 847-849.
  • КаляеваМ.А., ИвановаЕ.Г., ДоронинаН.В., ЗахарченкоН.С., ТроценкоЮ.А., БурьяновЯ.И. Влияние аэробных метилотрофных бактерий на морфогенез пшеницы мягкой (Triticum aestivum L.) in vitro // Физиология растений. 2003. Т. 50. №3. С.354-359.
  • КаляеваМ.А., ДоронинаН.В., ИвановаЕ.Г., ТроценкоЮ.А., БурьяновЯ.И. Применение аэробных метилобактерий и метанотрофов для индукции морфогенеза пшеницы мягкой (Triticum aestivum L.) in vitro // Биотехнология. 2003. №2. С. 38-44.
  • Троценко Ю.А., Доронина Н.В. Биология аэробных метилобактерий-деструкторов галометанов // Микробиология. 2003. Т. 72. №2. С. 149-160.
  • DunfieldP., KhmeleninaV.N., SuzinaN.E., TrotsenkoY.A., DedyshS.N. Methylocellasilvestris sp. nov. a novel methanotrophic bacterium isolated from an acidic forest cambisol // Int. J. Syst. Evol. Microbiol. 2003. V. 53. №3. P. 1231-1239.
  • Doronina N.V., Darmaeva Ts. D., Trotsenko Y.A. Methylophaga natronica sp. nov., a new alkaliphilic and moderately halophilic, restricted-facultative methylotrophic bacterium from soda lake of the Southern Transbaikal region // Syst. Appl. Microbiol. 2003. V. 26. №4. P. 382-389.
  • Zyakun A.M., Doronina N.V., Zakharchenko V.N., Firsova Yu.E., Trotsenko Yu.A. Fractionation of chlorine isotopes by methylotrophic bacteria during growth on dichloromethane // In: Proc. 5th Intern. Symp. on Applied isotope geochemistry. Eds.: A.S.Andrew, S.D. Golden // Heron Island. 2003. P. 187-189.
  • Dedysh S.N., Berestovskaya Y.Y., Vasylieva L.V., Belova S.E., Belova S.E., Khmelenina V.N., Suzina N.E., Trotsenko Y.A., Liesack W., Zavarzin G.A. Methylocella tundrae sp. nov., a novel methanotrophic bacterium from acidic peatlands of tundra // Int. J. Syst. Evol. Microbiol. 2004. V. 52. №1. P. 151-156.
  • Sorokin D.Y., Gorlenko M.V., Namsaraev B.B., Nam,saraev Z.B., Tourova T.P., Lysenko A.M., Eshinimaev B.Ts., Khmelenina V.N., Trotsenko Y.A., Kuenen G.J. Microbial communities of the northern-east Mongolian soda lakes // Hydrobiologia. 2004. V. 522.    № 1-3, P. 235-248.
  • Doronina N.V., Trotsenko Y.A., Kolganova T.V., Tourova T.P., Salkinoja-Salonen M.S. Methylobacillus pratensis sp. nov. – a novel non-pigmented aerobic obligatory methylotrophic bacterium isolated from meadow grass // Int. J. Syst. Evol. Microbiol. 2004. V. 54. №5. P. 1453-1457.
  • Dedysh S.N., Dunfield P.F., Trotsenko Y.A. Methane utilization by Methylobacterium species: new evidence but still no proof for an old controversy // Int. J. Syst. Evol. Microbiol. 2004. V. 54. №6. P. 1919-1920.
  • Buryanov Y., Patrushev L., Trotsenko Y. Biotechnology and genetic engineering reviews, Vol 17. Edited by SE Harding. Intercept Ltd, Andover, Hampshire, 2000. pp 589. ISBN 1898298610 // J. Chem. Technol. Biotechnol. 2004. V. 79. № 4. P. 428-429.
  • Lin J.-L., Radajewski S., Trotsenko Y.A., McDonald I.R., Murrell J.C. Molecular diversity of methanotrophs in Transbaikal soda lake sediments and identification of potentially active populations by stable isotope probing // Environ. Microbiol. 2004. V.6. №10. P. 1049-1060.
  • Фирсова Ю.Е., Доронина Н.В., Троценко Ю.А. Физиолого-биохимический анализ трансформантов аэробных метилобактерий, экспресирующих ген дихлорметандегалогеназы dcmA // Микробиология. 2004. Т. 73. №1. С. 31-36.
  • Данилова И.В, Доронина Н.В., Троценко Ю.А., Нетрусов А.И., Рыжкова Е.П. (Иордан) Участие витамина В12 в биосинтезе ДНК у Methylobacteriumdichloromethanicum,зависимое от интенсивности аэрации // Микробиология. 2004. Т. 73. №2. С. 169-174.
  • Курбатова Е.М., Дутова Т.А., Серкова Н.Н., Рабинович Я.М., Троценко Ю.А. Выделение и первичная характеристика мутантов по биогенезу пероксисом у метилотрофных дрожжей Hansenulapolymorpha // Генетика. 2004. Т. 40. №5. С. 592-598.
  • Решетников А.С., Хмеленина В.Н., Троценко Ю.А. Обнаружение генов биосинтеза эктоина у галотолерантных аэробных метилотрофных бактерий // Докл. АН. 2004. Т. 396. №6. С. 831-834.
  • Ешинимаев Б.Ц., Медведкова К.А., Хмеленина В.Н., Сузина Н.Е., Осипов Г.О., Лысенко А.М., Троценко Ю.А. Новые термофильные метанотрофы рода Methylocaldum // Микробиология. 2004. М. 73. №4. С. 530-539.
  • Доронина Н.В., Иванова Е.Г., Сузина Н.Е., Троценко Ю.А. Метанотрофы и метилобактерии обнаружены в тканях древесных растений в зимний период // Микробиология. 2004. Т. 73. №6. С. 817-824.
  • Курбатова Е.М., Дутова Т.А., Троценко Ю.А. Структурно-функциональные и генетические аспекты биогенеза пероксисом // Генетика. 2005. Т. 41. №2. С. 149-165.
  • Reshetnikov A.S., Khmelenina V.N., Mustakhimov. I.I., Ryzhmanova Y.V, Trotsenko Y.A. Genes and enzymes of ectoine biosynthesis in the haloalkaliphilic obligate methanotroph “Methylomicrobium alcaliphilum 20Z” / In: Adaptation to life at high salt concentration in Archae, Bacteria and Eukarya. Eds.: N. Gunde-Cimerman, A. Oren, A. Plemenitas // Dordrecht: Springer Science + Business Media B.V. 2005. V.9. P. 329-338.
  • РешетниковА.С., МустахимовИ.И., ХмеленинаВ.Н., ТроценкоЮ.А. Клонирование, очистка и характеристика диаминобутиратацетилтрансферазы из галотолерантного метанотрофа Methylomicrobium alcaliphilum 20Z // Биохимия. 2005. Т. 70. №8. С. 1063-1069.
  • Tsubota J., Eshinimaev B.Ts., Khmelenina V.N., Trotsenko Y.A. Methylothermus thermalis gen. nov., sp. nov. – a novel moderately thermophilic obligate methanotroph from a hot spring in Japan // Int. J. Syst. Evol. Microbiol. 2005. V. 55. № 5. P. 1877-1884.
  • СмирноваК.В., ДедышС.Н., ХмеленинаВ.Н., ТроценкоЮ.А. Пути метаболизма метанола и глюкозы у Beijerinckia mobilis // Микробиология. 2005. Т. 74. №5. С. 707-710.
  • Фирсова Ю.Е., Торгонская М.Л., Доронина Н.В., Троценко Ю.А. Влияние ДНК-повреждающих факторов на аэробные метилобактерии, использующие и не использующие дихлорметан // Прикл. биохим. микробиол. 2005. Т. 41. №5. С. 547-552.
  • Троценко Ю.А., Доронина Н.В., Хмеленина В.Н. Биотехнологический потенциал аэробных метилотрофных бактерий: настоящее и будущее // Прикл. биохим. микробиол. 2005. Т. 41. №5. С. 495-503.
  • Доронина Н.В., Ли Ц.Д., Иванова Е.Г., Троценко Ю.А. Methylophagamuratasp.nov. – галоалкалотолерантный аэробный метилотроф из разрушающегося мрамора // Микробиология. 2005. Т. 74. №4. С. 511-519.
  • Гайнутдинова Е.А., Ешинимаев Б.Ц., Цыренжапова И.С., Дагурова О.П., Сузина Н.Е., Хмеленина В.Н., Намсараев Б.Б., Троценко Ю.А. Метанотрофные сообщества донных осадков озера Байкал // Микробиология. 2005. Т. 74. №4. С. 562-571.
  • Trotsenko Y.A., Khmelenina V.N. Aerobic methanotrophic bacteria of cold ecosystems // FEMS Microbiol. Ecol. 2005. V. 53. №1. Р. 15-26.
  • Dedysh S.N., Smirnova K.V., Khmelenina V.N., Suzina N.E., Liesack W., Trotsenko Y.A. Methylotrophic autotrophy in Beijerinckia mobilis //J. Bacteriol. 2005. V. 187. №11. Р. 3884-3888.
  • Doronina N., Ivanova E., Trotsenko Y., Pshenichnikova A.,Kalinina E. and Shvets V. Methylophilus quaylei sp.nov., a new aerobic obligately methylotrophic bacterium // System. Appl. Microbiol. 2005. V. 28. № 4. Р. 303-309.
  • Doronina N.V., Ivanova E.G., Trotsenko Y.A. Phylogenetic position and emended description of the genus Methylovorus // Int. J. Syst. Evol. Microbiol. 2005. V. 55. №2. Р. 903-906.
  • Doronina N.V., Trotsenko Y.A. Genus Methylarcula / In: The Alpha-, Beta-, Delta- and Epsilonproteobacteria, Part C, Bergey's Manual of systematic bacteriology. 2nd. Edn. Eds.: D.J. Brenner, N.R. Krieg, J.T. Staley, G.M. Garrity // New York: Springer Science + Business Media. 2005. V. 2. P. 192-194.
  • Doronina N.V., Trotsenko Y.A. Genus Albibacter / In: The Alpha-, Beta-, Delta- and Epsilonproteobacteria, Part C, Bergey's Manual of systematic bacteriology. 2nd. Edn. Eds.: D.J. Brenner, N.R. Krieg, J.T. Staley, G.M. Garrity // New York: Springer Science + Business Media. 2005. V. 2. P. 416-420.
  • Trotsenko, Y.A., N.V. Doronina, Genus Methylopila / In: The Alpha-, Beta-, Delta- and Epsilonproteobacteria, Part C, Bergey's Manual of systematic bacteriology. 2nd. Edn. Eds.: D.J. Brenner, N.R. Krieg, J.T. Staley, G.M. Garrity // New York: Springer Science + Business Media. 2005. V. 2. P. 420-422.
  • Trotsenko, Y.A., N.V. Doronina, Genus Methylorhabdus / In: The Alpha-, Beta-, Delta- and Epsilonproteobacteria, Part C, Bergey's Manual of systematic bacteriology. 2nd. Edn. Eds.: D.J. Brenner, N.R. Krieg, J.T. Staley, G.M. Garrity // New York: Springer Science + Business Media. 2005. V. 2. P. 525-527.
  • Назаров Н.М., Доронина Н.В., Троценко Ю.А., Малых Е.Ю., Бицадце Н.А. Удаление вредных примесей из имитатора конденсата атмосферной влаги обитаемых замкнутых помещений, сформированной бактериальной ассоциацией // Авиакосмическая и экологическая медицина. 2005. Т. 39. №2. С. 49-54.
  • Решетников А.С., Мустахимов И.И., Хмеленина В.Н., Бесчастный А.П., Троценко Ю.А. Идентификация и клонирование гена пирофосфатзависимой 6-фосфофруктокиназы облигатного метанотрофа Methylomonasmethanica // Докл. АН. 2005. Т. 405. №6. С. 837-839.
  • Reshetnikov A.S., Khmelenina V.N., Trotsenko Y.A. Characterization of the ectoine biosynthesis genes in obligate haloalkalotolerant methanotroph Methylomicrobium alcaliphilum 20Z // Arch. Microbiol. 2006. V. 184. №5. P. 286-296.
  • Доронина Н.В., Назаров Н.М., Ежов В.А., Троценко Ю.А. Биодеградация метилацетата и этилацетата иммобилизованными клетками Pseudomonasesterophilus. // Прикл. биохим. микробиол. 2006. Т. 42. №1. С. 52-54.
  • Гальченко В.Ф., Троценко Ю.А. Метанотрофия как научное направление / В сб.: Труды Института микробиологии. Ред.: В.Ф. Гальченко // М: «Наука». 2006. Т. 13. С. 5-23.
  • Хмеленина В.Н., Троценко Ю.А. Особенности метаболизма облигатных метанотрофов / В сб.: Труды Института микробиологии. Ред.: В.Ф. Гальченко // М: «Наука». 2006. Т. 13. С. 24-44.
  • Хмеленина В.Н., Ешинимаев Б.Ц., Решетников А.С., Сузина Н.Е., Троценко Ю.А. Аэробные метанотрофы экстремальных экосистем / В сб.: Труды Института микробиологии. Ред.: В.Ф. Гальченко // М: «Наука». 2006. Т. 13. С. 147-171.
  • Иванова Е.Г., Доронина Н.В., Троценко Ю.А. Аэробные метанотрофы как симбионты растений / В сб.: Труды Института микробиологии. Ред.: В.Ф. Гальченко // М: «Наука». 2006. Т. 13. С. 262-283.
  • Доронина Н.В., Троценко Ю.А. Метаболизм метанола и глюкозы у Angulomocrobiumtetraedrale//Микробиология. 2006. Т. 75. №3. С. 420-423.
  • Доронина Н.В., Капаруллина Е.Н., Вайнштейн М.Б., Троценко Ю.А. Метаболизм облигатного деструктора этилендиаминтетраацетата // Микробиология. 2006. Т. 75. №3. С. 424-426.
  • Иванова Е.Г., Федоров Д.Н., Доронина Н.В., Троценко Ю.А. Образование витамина В12 аэробными метилотрофными бактериями // Микробиология. 2006. Т. 75. №4. С. 570-572.
  • Minkevich I.G., Satroutdinov A.D., Dedyukhina E.G., Chistyakova T.I., KaparullinaE.N., KoshelevA.V., OkunevO.N. The effect of temperature on bacterial degradation of EDTA in pH – auxostat // World J. Microbiol. Biotechnol. 2006. V 22. №11. Р.1205-1213.
  • Торгонская М.Л., Фирсова Ю.Е., Доронина Н.В., Троценко Ю.А. Адаптация аэробных метилобактерий к деградации дихлорметана // Прикл. биохим. микробиол. 2007. Т. 43. №1. С. 53-58.
  • Ешинимаев Б.Ц., Цыренжапова И.С., Хмеленина В.Н., Троценко Ю.А. Определение содержания осмопротектора эктоина у метилотрофных бактерий нормально-фазовой ВЭЖХ // Прикл. биохим. микробиол. 2007. Т. 43. №2. С. 215-218.
  • Ли Ц.Д., Доронина Н.В., Иванова Е.Г., Троценко Ю.А. В12-независимые изоляты Methylophagamarinaс водорослей Красного моря // Микробиология. 2007. Т. 76. №1. С. 88-94.
  • Цыренжапова И.С., Ешинимаев Б.Ц., Хмеленина В.Н., Осипов Г.О., Троценко Ю.А. Новый термотолерантный метанотроф из термального источника Бурятии // Микробиология. 2007. Т. 76. №1. С.132-135.
  • SorokinD.Y., TrotsenkoY.A., DoroninaN.V., TourovaT.P., GalinskiE., KolganovaT., MuyzerG. Methylohalomonaslacusgen. nov. sp. nov.andMethylonatrumkenyensegen.nov. sp.nov. – methylotrophic Gammaproteobacteriafromhypersaline lakes // Int. J. Syst. Evol. Microbiol. 2007. V. 57. № 12. P. 2762-2769.
  • Троценко Ю.А., Доронина Н.В., Ли Ц.Д., Решетников А.С. Умеренно галоалкалофильные аэробные метилобактерии // Микробиология. 2007. Т. 76. №3. С. 293-305.
  • Медведкова К.А., Хмеленина В.Н., Троценко Ю.А. Сахароза как фактор термоадаптации термофильного метанотрофа Methylocaldumszegediense O-12 // Микробиология. 2007. Т. 76. №4. С. 567-569.
  • DedyshS.N., BelovaS.E., BodelierP.L.E., SmirnovaK.V., KhmeleninaV.N., ChidthaisongA., TrotsenkoY.A., LiesackW.,DunfieldP.F. Methylocystisheyeriisp. nov., a novel type II methanotrophic bacterium possessing “signature” fatty acids of type I methanotrophs // Int. J. Syst. Evol. Microbiol. 2007. V. 57. №3. Р.472-479.
  • Ivanova E.G., Doronina N.V., Trotsenko Y.A. Hansshlegelia plantiphila gen nov. sp. nov., a new aerobic restricted facultative methylotroph associated with plants // Syst. Appl.. Microbiol. 2007. V. 30. №6. P. 444-452.
  • Зякун А.М.,  Фирсова Ю.Е., Торгонская М.Л., Доронина Н.В., Троценко Ю.А. Вариации изотопного состава хлора как показатель бактериального дегалогенирования дихлорметана // Прикл. биохим. микробиол. 2007. Т. 44. №6. С. 666-671.
  • KimH. G., DoroninaN.V., TrotsenkoY.A., KimS.W. Methylophagaaminisulfidivoranssp.nov., a novel restricted facultatively methylotrophic marine bacterium // Int. J. Syst. Appl. Microbiol. 2007. V. 57. №9. P. 2096-2101.
  • Kalyuzhnaya M., Khmelenina V.N., Eshinimaev B. Ts., Sorokin D. Y., Fuse H., Lidstrom M., Trotsenko Y.A. Classification of halo(alkali)philic and halo(alkali)tolerant methanotrophs provisionally assigned to the genera Methylomicrobium and Methylobacter and emended description of the genus Methylomicrobium // Int. J. Syst. Evol. Microbiol. 2007. V. 58. №3. Р. 591-596.
  • Ешинимаев Б.Ц., Хмеленина В.Н., Троценко Ю.А. Метанотроф II типа, выделенный впервые из содового озера // Микробиология. 2008. Т. 77. №5. С. 704-707.
  • MustakhimovI.I., RozovaO.N., ReshetnikovA.S., KhmeleninaV.N., MurrellC.J., TrotsenkoY.A. Characterization of the recombinant diaminnobutyric acid acetyltransferase from MethylophagathalassicaandMethylophagaalcalica//FEMS Microbiol. Lett. 2008. V. 283. №1. P. 91-96.
  • Trotsenko Y.A., Murrell J.C.M. Metabolic aspects of obligate aerobic methanotrophy // Adv. Appl. Microbiol. 2008. V. 63. Ch. 5. Р. 183-229.
  • Капаруллина Е.Н., Федоров Д.Н., Доронина Н.В., Троценко Ю.А. Система олигонуклеотидных праймеров для детекции и амплификации бактериального гена этилендиаминтетраацетата emoA // Прикл. биохим. микробиол. 2008. Т. 44. №4. С. 399-403.
  • Доронина Н.В., Ежов В.А., Троценко Ю.А. Культивирование на метане и биосинтез полибетагидроксибутирата Methylosinustrichosporium OB3b // Прикл. биохим. микробиол. 2008. Т. 44. №2. С. 182-185.
  • Бесчастный А.П., Хмеленина В.Н., Розова О.Н., Троценко Ю.А. Активности 6-фосфофруктокиназы и неорганической пирофосфатазы у аэробных метилотрофных бактерий // Микробиология. 2008. Т. 77. №5. С. 713-715.
  • Федоров Д.Н., Иванова Е.Г., Доронина Н.В., Троценко Ю.А. Новая система вырожденных олигонуклеотидных праймеров для детекции и амплификации nifHDгенов // Микробиология. 2008. Т. 77. №2. С. 286-288.
  • Медведкова К.А., Хмеленина В.Н., Троценко Ю.А. Синтез меланина умеренно термофильным метанотрофом Methylocaldumszegediense зависит от температуры культивирования // Микробиология. 2008. Т. 77. №1. С. 126-128.
  • ReshetnikovA.S., MustakhimovI.I., RozovaO.N., BeschastnyA.P., KhmeleninaV.N., MurrellJ.C., TrotsenkoY.A. Characterization of pyrophosphate-dependent 6-phosphofructokinase from Methylococcuscapsulatus Bath // FEMS Microbiol. Lett. 2008. V. 288. №2. P. 202-210.
  • Pirttilä A.M., Hohtola A., Ivanova E.G., Fedorov D.N., Doronina N.V., Trotsenko Y.A. Localization of plant-associated bacteria by in situ hybridization / In: Prospects and applications for plant-associated microbes. A laboratory manual. Part A: Bacteria. Eds.: S. Sorvari, A.M. Pirttilä // Turku: Biobien Innovations. 2008. P. 61-64.
  • Ivanova E.G., Pirttilä A.M., Fedorov D.N., Doronina N.V., Trotsenko Y.A. Methods to study bioactivity in plant-methylotroph interaction / In: Prospects and applications for plant-associated microbes. A laboratory manual. Part A: Bacteria. Eds.: S. Sorvari, A.M. Pirttilä // Turku: Biobien Innovations. 2008. P. 65-69.
  • Pirttilä A.M., Hohtola A., Ivanova E.G., Fedorov D.N., Doronina N.V., Trotsenko Y.A. Identification and localization of methylotrophic plant-associated bacteria / In: Prospects and applications for plant-associated microbes. A laboratory manual. Part A: Bacteria. Eds.: S. Sorvari, A.M. Pirttilä // Turku: Biobien Innovations. 2008. P. 218-224.
  • Ivanova E.G., Pirttilä A.M., Fedorov D.N., Doronina N.V., Trotsenko Y.A. Association of methylotrophic bacteria with plants: Metabolic aspects / In: Prospects and applications for plant-associated microbes. A laboratory manual. Part A: Bacteria. Eds.: S. Sorvari, A.M. Pirttilä // Turku: Biobien Innovations. 2008. P. 225-231.
  • Троценко Ю.А., Торгонская М.Л. Аэробная биодеградация дихлорметана: структурно-функциональные аспекты // Прикл. биохим. микробиол. 2009. Т. 45. №3. С. 261-276.
  • Козловский А.Г., Троценко Ю.А. Рецензия на книгу А.М. Безбородова, Н.А. Загустиной, В.О. Попова «Ферментативные реакции в биотехнологии» // Микробиология. 2009. Т. 45. №3. С. 424-426.
  • KaparullinaE., DoroninaN., ChistyakovaT., TrotsenkoY. Stenotrophomonaschelatiphagasp. nov., a new aerobic EDTA-degrading bacterium // Syst. Appl. Microbiol. 2009. V. 32. №1. P. 157-162.
  • Троценко Ю.А., Медведкова К.А., Хмеленина В.Н., Ешинимаев Б.Ц. Термофильные и термотолерантные аэробные метанотрофы // Микробиология. 2009. Т. 78. №4. С. 435-450.
  • Зеленкина Т.С., Ешинимаев Б.Ц., Дагурова О.П., Сузина Н.Е., Намсараев Б.Б., Троценко Ю.А. Аэробные метанотрофы прибрежных гидротерм озера Байкал // Микробиология. 2009. Т. 45. №4. C. 545-551.
  • Smith T., Trotsenko Y.A., Murrell J.C. Physiology and biochemistry of the aerobic methane oxidizing bacteria / In: Handbook of hydrocarbon and applied microbiology. Ed.: K.N. Timmis // Heidelberg: Springer. 2009. V. 196. №10. P. 765-779.
  • Firsova J., Doronina N., Lang E., Spröer C., Vuilleumier S., Trotsenko Y. Ancylobacter dichloromethanicus sp. nov. – a new aerobic faculatively methylotrophic bacterium utilizing dichloromethane // Syst. Appl. Microbiol. 2009. V. 32. №4. P. 227-232.
  • Vorob’ev A.V., de Boer W., Folman L.B., Bodelier P.L.E., Doronina N.V., Suzina N.E., Trotsenko Y.A., Dedysh S.N. Methylovirgula ligni gen. nov. sp. nov., an obligately acidophilic, facultatively methylotrophic bacterium with highly divergent mxaF gene // Int. J. Syst. Evol. Microbiol. 2009. V. 59. № 10. P. 2538-2545.
  • Федоров Д.Н., Бут С.Ю., Доронина Н.В., Троценко Ю.А. Влияние экзогенной индолилуксусной кислоты на активность ферментов центрального метаболизма у Methylobacteriumextorquens // Микробиология. 2009. Т. 78. №6. С. 844-846.
  • Медведкова К.А., Хмеленина В.Н., Сузина Н.Е., Троценко Ю.А. Антиоксидантные системы умеренно термофильных метанотрофов Methylocaldumszegediense и Methylococcuscapsulatus // Микробиология. 2009. Т. 78. №6. С. 723-730.
  • Пиголева С.В., Захарченко Н.С., Пиголев А.В., Троценко Ю.А., Бурьянов Я.И. Влияние колонизирующих метилобактерий на морфогенез и устойчивость к Erwiniacarotovoraсахарной свеклы и капусты белокочанной // Прикл. биохим. микробиол. 2009. Т. 45. №6. С. 670-676.
  • Капаруллина Е., Доронина Н., Трилисенко Л., Вагабов В., Троценко Ю. Особенности метаболизма Chelativorans oligotrophicus при двухфазном росте на смеси ЭДТА и глюкозы // Прикл. биохим. микробиол. 2009. Т. 45. №5. С. 555-560.
  • Мустахимов И., Решетников А., Хмеленина В., Троценко Ю. EctR – новый транскрипционный регулятор генов биосинтеза эктоина у галофильной метилобактерии Methylophaga alcalica // Докл. АН. 2009. Т. 429. №2. С. 263-266.
  • Доронина Н.В., Федоров Д.Н., Троценко Ю.А., Смолянина С.О., Беркович Ю.А. Стимуляция облигатными метилотрофными бактериями морфогенеза и антигрибной устойчивости китайской капусты BrassicachinenseL. // Биотехнология. 2009. №6. С. 56-61.
  • Belova S. E., Pankratov T.A., Detkova E.N., Kaparullina E.N., Dedysh S.N. Acidisoma tundrae gen. nov., sp. nov. and Acidisoma sibiricum sp. nov., two acidophilic, psychrotolerant members of the Alphaproteobacteria from acidic northern wetlands / Int. J. Syst. Evol. Microbiol. 2009. V. 59, 2283–2290.
  • DoroninaN.V., KaparullinaE.N., TrotsenkoY.A., NoertemannB., Bucheli-WitschelM., WeilenmannH.-U., EgliT. Chelativoransmultitrophicusgen. nov., sp. nov. and Chelativoransoligotrophicussp. nov., aerobic, EDTA-degrading bacteria // Int. J. Syst. Evol. Microbiol. 2010. V. 60. №5. P. 1044-1051.
  • Mustakhimov I.I., Reshetnikov A.S., Glukhov A.S., Khmelenina V.N., Kalyuzhnaya M.G., Trotsenko Y.A. Identification and сharacterization of EctR1, a new transcriptional regulator of the ectoine biosynthesis genes in the halotolerant methanotroph Methylomicrobium alcaliphilum 20Z // J. Bacteriol. 2010. V. 192. №2. P. 410-417.
  • Фирсова Ю.Е., Доронина Н.В., Троценко Ю.А. Анализ ключевых функциональных генов у новых аэробных деструкторов дихлорметана // Микробиология. 2010. Т. 79. №1. С. 72-78.
  • Доронина Н.В., Ежов В.А., Бесчастный А.П., Троценко Ю.А. Биосинтез биопротектора эктоина аэробными метилотрофными бактериями // Прикл. биохим. микробиол. 2010. Т. 46. №2. С. 187-190.
  • Хмеленина В.Н., Щукин В.Н., Решетников А.С., Мустахимов И.И., Сузина Н.Е., Ешинимаев Б.Ц., Троценко Ю.А. Структурно-функциональные особенности метанотрофов гиперсоленых и щелочных водоемов // Микробиология. 2010. Т. 79. №4. С. 498-508.
  • Мустахимов И.И., Решетников А.С., Хмеленина В.Н., Троценко Ю.А. Регуляторные аспекты биосинтеза эктоинов у галофильных бактерий // Микробиология. 2010. Т. 79. №5. С. 595-604.
  • Розова О.Н., Хмеленина В.Н., Мустахимов И.И., Решетников А.С., Троценко Ю.А. Характеристика рекомбинантной фруктозо-1,6-бисфосфатальдолазы Methylococcuscapsulatus Bath // Биохимия. 2010. Т. 75. №7. С. 1014-1022.
  • Решетников А.С., Хмеленина В.Н., Троценко Ю.А. Идентификация генов синтеза эктоина у умеренно галофильной альфапротеобактерии Methylarcula marina // Микробиология. 2010. Т. 79. №6. С. 859-860.
  • Федоров Д.Н., Доронина Н.В., Троценко Ю.А. Клонирование и характеристика индолил-3-пируватдекарбоксилазы, участвующей в биосинтезе ИУК у Methylobacterium extorquens AM1 // Биохимия. 2010. Т. 75. №12. С. 1651-1661.
  • Khmelenina V.N., Mustakhimov I.I., Reshetnikov A.S., Kalyuzhnaya M.G., Trotsenko Y.A. Genetic and biochemical aspects of ectoine biosynthesis in moderately halophilic and halotolerant methylotrophic bacteria // Amer. J. Agric. Biol. Sci. 2010. V. 5. №4. P. 446-458.
  • КапаруллинаЕ.Н., ДоронинаН.В., ТроценкоЮ.А., АлферовВ.А. Участие иминодиацетат оксидазы в деградации этилендиаминтетраацетата у облигатного деструктора Chelativorans oligotrophicus LPM-4 // Изв. Тульского Госуниверситета. Ест. Науки. 2010. Вып. 2. С. 271-278.
  • Gogleva A.A., Kaparullina E.N., Doronina N.V., Trotsenko Y.A. Methylophilus flavus sp. nov. and Methylophilus luteus sp. nov., aerobic, methylotrophic bacteria associated with plants // Int. J. Syst. Evol. Microbiol. 2010. V. 60. № 11. P. 2623-2628.
  • Li L., Zheng J.-W., Hang B.-J., Doronina N.V., Trotsenko Y.A., He J., Li S.-P. Methylopila jiangsuensis sp. nov., a novel aerobic facultatively methylotrophic bacterium // Int. J. Syst. Evol. Microbiol. 2011. V. 61. №7. P. 1561-1566.
  • Trotsenko Y.A. Ekstremofilne metanotrofy: od genomu do biotechnologii / In: Barwy nauki. Novoczesne technologie ICT w upowszechnianiua oriagniec nauki // Liublin. 2010. P. 684-696.
  • Беркович Ю.А., Доронина Н.В., Федоров Д.Н., Мухамедиева Л.Н., Микос К.Н., Кривобок Н.М., Смолянин В.Г., Смолянина С.О., Шантурин Н.А. Влияние ассоциированных с растениями метилотрофных бактерий на динамику концентрации метана и метанола в атмосфере герметичной камеры // Авиакосмическая и экологическая медицина. 2010. Т. 44. №1. С. 54-58.
  • Доронина Н.В., Федоров Д.Н., Шихсаидов М.В., Понаморева О.Н. Стимуляция роста и морфогенеза растений invitro ассоциативными аэробными метилотрофными бактериями MethylobacteriumextorquensD10, образующими цитокинины, ауксины и витамин В12 // Изв. Тульского Госуниверситета. Ест. Науки. 2010. Вып. 1. С. 215-225.
  • VorobevA.V., BaaniM., DoroninaN.V., BradyA.L., LiesackW., DunfieldP.F., DedyshS.N. Methyloferula stellata gen. nov., sp. nov., an acidophilic, obligately methanotrophic bacterium possessing only a soluble methane monooxygenase // Int. J. Syst. Evol. Microbiol. 2011. V. 61. № 10. P. 2456-2463.
  • Rozova O.N., Khmelenina V.N., Vuilleumier S., Trotsenko Y.A. Characterisation of the recombinant pyrophosphate-dependent 6-phosphofructokinase from halotolerant methanotroph Methylomicrobium alcaliphilum 20Z // Res. Microbiol. 2011. V. 161. №10. P. 861-868.
  • Khmelenina V.N., Rozova O.N., Trotsenko Y.A. Characterization of the recombinant pyrophosphate-dependent 6-phosphofructokinases from Methylomicrobium alcaliphilum 20Z and Methylococcus capsulatus Bath // Methods Enzymol. 2011. V. 495. Ch. 1. P. 1-15.
  • ReshetnikovA.S., KhmeleninaV.N., MustakhimovI.I., TrotsenkoY.A. Genes and enzymes of ectoine biosynthesis in halotolerant methanotrophs // Methods Enzymol. 2011. V. 495. Ch. 2. P. 16-24.
  • TorgonskayaM.L., DoroninaN.V., HourcadeE., TrotsenkoY.A., VuilleumierS. Chloride-associated adaptive response in aerobic methylotrophic dichloromethane-utilising bacteria // J. Basic Microbiol. 2011. V. 51. №2. Р. 296-303.
  • Федоров Д.Н., Доронина Н.В., Троценко Ю.А. Фитосимбиоз аэробных метилобактерий: новые факты и гипотезы // Микробиология. 2011. Т. 80. №4. С. 435-446.
  • Щукин В.Н., Хмеленина В.Н., Ешинимаев Б.Ц., Сузина Н.Е., Троценко Ю.А. Первичная характеристика поверхностных белков галотолерантного метанотрофа Methylomicrobiumalcaliphilum 20Z // Микробиология. 2011. Т. 80. №5. С. 595-605.
  • Доронина Н.В., Капаруллина Е.Н., Троценко Ю.А. Methylovorusmenthalis – новый вид аэробных облигатных метилобактерий, ассоциированных с растениями // Микробиология. 2011. Т. 80. №5. С. 700-706.
  • GoglevaA.A., KaparullinaE.N., DoroninaN.V., TrotsenkoY.A. Methylobacillusarboreussp. nov., and Methylobacillusgramineus sp. nov., novel non-pigmented obligately methylotrophic bacteria associated with plants // Syst. Appl. Microbiol. 2011. V. 34. № 7.                    P. 477-481.
  • Капаруллина Е.Н., Быкова Т.В., Федоров Д.Н., Доронина Н.В., Троценко Ю.А. Метаболизм метанола у ризосферного фитосимбионта Methylobacteriumnodulans // Микробиология. 2011. Т. 80. №6. С. 847-849.
  • Капаруллина Е.Н., Доронина Н.В., Троценко Ю.А. Аэробная деградация этилендиаминтетраацетата (обзор) // Прикл. биохим. микробиол. 2011. Т. 47. №5. С. 508-522.
  • Хмеленина В.Н., Медведкова К.А., Троценко Ю.А. Термофильные аэробные метанотрофы / В сб.: Труды Института микробиологии. Ред.: В.Ф. Гальченко // Москва. 2011. Т. 16. С. 105-128.
  • Козловский А.Г., Троценко Ю.А. Рецензия на книгу А.М. Безбородова и Г.И. Квеситадзе «Микробиологический синтез» // . С. 575-576.
  • Фирсова Ю.Е., Федоров Д.Н., Троценко Ю.А. Анализ 3’-региона гена дихлорметандегалогеназы dcmA Methylobacteriumdichloromethanicum ДМ4 // Микробиология. 2011. Т. 80. №6. С. 796-802.
  • Ешинимаев Б.Ц., Лапин А.А., Бесчастный А.П., Троценко Ю.А. Генетическая модификация синтеза полигидроксибутирата у Methylobacteriumextorquens // Изв. Тульского Госуниверситета. 2011. Вып. 2. С. 334-344.
  • ReshetnikovA.S., KhmeleninaV.N., MustakhimovI.I., KalyuzhnayaM.G., LidstromM.E., TrotsenkoY.A. Diversity and phylogeny of the ectoine biosynthesis genes in aerobic, moderately halophilic methylotrophic bacteria // Extremophiles. 2011. V. 15. № 6. P. 653–663.
  • DoroninaN.V., GoglevaA.A., TrotsenkoY.A. Methylophilusglucosoxydans sp. nov., a restricted facultative methylotroph from rice rhizosphere // Int. J. Syst. Evol. Microbiol., 2012. V. 62. № 1. P. 196-201.
  • Rozova O.N., Khmelenina V.N., Trotsenko Y.A. // Биохимия. 2012. Т. 77. № 3. С. 367-371.
  • Капаруллина Е.Н., Порошина М.Н., Доронина Н.В., Ковалевская Н.П. Новые штаммы аэробных метилотрофных бактерий из биотопов Соликамска // Вестник Уральской медицинской академической науки. 2011. № 4/1 (38). С. 79-80.
  • Sorokin D.Y., Panteleeva A.N., Tourova T.P., Kaparullina E.N., Muyzer G. Natronoflexus pectinovorans gen. nov. sp. nov., an obligately anaerobic and alkaliphilic fermentative member of Bacteroidetes from soda lakes // Extremophiles. 2011. V. 15. № 6. P. 691-696.
  • Sorokin D.Y., Tourova T.P., Panteleeva A.N., Kaparullina E.N., Muyzer G. Anaerobic utilization of pectinous substrates at extremely haloalkaline conditions by Natranaerovirga pectinivora gen. nov., sp. nov., and Natranaerovirga hydrolytica sp.nov., isolated from hypersaline soda lakes // Extremophiles. 2012. V. 16. № 2. P. 307-315.
  • Pankratov T.A., Kirsanova L.A., Kaparullina E.N., Kevbrin V.V., Dedysh S.N. Telmatobacter bradus gen. nov., sp. nov., a cellulolytic facultative anaerobe from subdivision 1 of the Acidobacteria and emended description of Acidobacterium capsulatum Kishimoto et al. 1991. // Int. J. Syst. Evol. Microbiol. 2011. V. 62. № 2. P. 430-437.
  • BerestovskayaJ.J., KotsyurbenkoO.R., TourovaT.P., KolganovaT.V., DoroninaN.V., GolyshinP.N., VasilyevaL.V. Methylorosulapolarisgen. nov., sp. nov., a new aerobic, facultatively methylotrophic psychotolerant bacterium from tundra wetland soil // Int. J. Syst. Evol. Microbiol. 2012. V. 62. № 3. P. 638-646.
  • Бут С.Ю., Розова О.Н., Хмеленина В.Н., Решетников А.С., Троценко Ю.А. Свойства рекомбинантной АТР-зависимой фруктокиназы галотолерантного метанотрофа Methylomicrobium alcaliphilum 20Z // Биохимия. 2012. Т. 77. № 4. С. 474-480.
  • Vuilleumier S., Khmelenina V.N., Bringel F., Reshetnikov A.S., Lajus A., Mangenot S., Rouy Z., Op den Camp H.J.M., Jetten M.S.M., Dispirito A.A., Dunfield P., Klotz M.G., Semrau J.D., Stein L.Y., Barbe V., digue C., Trotsenko Y.A., Kalyuzhnaya M.G. Genome sequence of the haloalkaliphilic methanotrophic bacterium Methylomicrobium alcaliphilum 20Z // J. Bacteriol. 2012. v. 194. № 2. P. 551-552.
  • Фирсова Ю.Е., Федоров Д.Н., Троценко Ю.А. Функциональный анализ геномного фрагмента, участвующего в аэробной деградации дихлорметана Methylobacterium dichloromethanicum ДМ4 // Прикл. биохим. микробиол. 2012. Т. 48. № 4. С. 516-521.
  • Капаруллина Е.Н., Доронина Н.В., Ежов В.А., Троценко Ю.А. Деградация ЭДТА иммобилизованными на биофильтре клетками Chelativorans oligotrophicus // Прикл. биохим. микробиол. 2012. Т. 48. № 4. C. 437-441.
  • Мустахимов И.И., Решетников А.С., Федоров Д.Н., Хмеленина В.Н., Троценко Ю.А. Роль белка EctR как транскрипционного регулятора генов биосинтеза эктоина у Methylophaga thalassica // Биохимия. 2012. Т. 77. № 8. С. 1044-1051.
  • Кувичкина Т.Н., Капаруллина Е.Н., Доронина Н.В., Троценко Ю.А., Решетилов А.Н. Деградация ЭДТА и его комплексов с металлами иммобилизованными клетками бактерий Chelativoransoligotrophicus LPM-4 // Прикл. биохим. микробиол. 2012. Т. 48. № 6. С. 626-630.
  • Кузнецова Т.А., Бесчастный А.П., Понаморёва О.Н., Троценко Ю.А. Очистка и характеристика метанолдегидрогеназы ризосферного фитосимбионта Methylobacteriumnodulans // Прикл. биохим. микробиол. 2012. Т. 48. № 6. C. 606-611.
  • AntonyC.P., DoroninaN.V., BodenR., TrotsenkoY.A., ShoucheY.S., MurrellJ.C. Methylophagalonarensis sp. nov., a novel moderately haloalkaliphilic methylotroph isolated from the soda lake sediments of a meteorite impact crater // Int. J. Syst. Evol. Microbiol. 2012. V. 62. № 7. P. 1613-1618.
  • Троценко Ю.А., Торгонская М.Л. Аэробные метилотрофы – перспективные объекты современной биотехнологии // Журнал Сибирского Федерального Университета. 2012. №3, С. 231-253.
  • Ежов В.А., Доронина Н.В., Троценко Ю.А. Биосинтез полигидроксибутировалерата с разной молекулярной массой при росте Methylobacteriumextorquens G-10 на смеси метанола и пентанола // Прикл. биохим. микробиол. 2013. т. 49. № 2. С. 171-174.
  • Бут С.Ю., Хмеленина В.Н., Мустахимов И.И., Троценко Ю.А. Получение и характеристика нокаут-мутантов Methylomicrobium alcaliphilum 20Z, дефектных по генам синтеза сахарозы и эктоина // Микробиология. 2013. т. 81. № 2. С. 1-3.

 

 
 


142290 Московская область, г.Пущино, пр-т Науки, д.5, Тел./факс: (495)956-33-70, boronin@ibpm.pushchino.ru; rta@ibpm.pushchino.ru; www.ibpm.ru


Разработка сайта - Alces