Публикации и патенты

Общий список публикаций за 2020 год

1. Abdullabekova  D.A., Magomedova  E.S., Aliverdieva  D.A., Kachalkin A.V.  Yeast Communities of Vineyards in Dagestan: Ecological, Taxonomic, and Genetic Characteristics // Biology Bulletin, 2020 v. 47, Is. 4, p. 344-351 DOI: 10.1134/S1062359020030024

2. Abramov V.M ., Kosarev I.V. , Priputnevich T.V. , Machulin A.V., Khlebnikov V.S., Pchelintsev S.Y, Vasilenko R.N., Sakulin V.K., Suzina N.E., Chikileva I.O., Derysheva E.I., Melnikov V.G, Nikonov I.N., Samoilenko V.A., Svetoch E.E., Sukhikh G.T. S-layer protein 2 of Lactobacillus crispatus 2029, its structural and immunomodulatory characteristics and roles in protective potential of the whole bacteria against foodborne pathogens // International Journal of Biological Macromolecules, 2020, v.150, p.400-412 DOI 10.1016/j.ijbiomac.2020.02.065

3. Afoshin A.S., Konstantinov M.A., Toropygin I.Y., Kudryakova I.V., Vasilyeva N.V. beta-Lytic Protease of Lysobacter capsici VKM B-2533T // Antibiotics, 2020, V.9, Is. 11, p. 1-14.   DOI: 10.3390/antibiotics9110744

4. Afoshin A.S., Kudryakova I.V., Borovikova A.O., Suzina N.E., Toropygin I.Y., Shishkova N.A., Vasilyeva N.V. Lytic potential of Lysobacter capsici VKM B-2533T: bacteriolytic enzymes and outer membrane vesicles // Scientific Reports V. 10, Is. 1, DOI: 10.1038/s41598-020-67122-2

5. Agafonova N.V., Kaparullina E.N., Grouzdev  D.S., Doronina N.V. Hansschlegelia quercus sp. nov., a novel methylotrophic bacterium isolated from oak buds // International journal of systematic and evolutionary microbiology, 2020, v. 70, Is. 8, p. 4646-4652 DOI: 10.1099/ijsem.0.004323 .

6.  Anokhina T.O., Esikova T.Z., Abashina T.N., Suzina N.E., Solyanikova I.P. New strains of bacteria that degrade aromatic compounds act as antagonists of highly active phytopathogens. Proceedings MDPI // // Proceedings, 2020, V. 66, Is. 1, DOI 10.3390/proceedings2020066002

7.  Anokhina T.O., Esikova T.Z., Gafarov A.B., Polivtseva V.N., Baskunov B.P., Solyanikova I..P. Alternative Naphthalene Metabolic Pathway Includes Formation of ortho-Phthalic Acid and Cinnamic Acid Derivatives in the Rhodococcus opacus Strain 3D // Biochemistry, 2020, V. 85, Is. 3, p. 355-368, DOI: 10.1134/S0006297920030116

8.  Antipova T.V., Zhelifonova V.P., Litovka Yu.A., Pavlov I.N., Baskunov B.P., Timofeev A.A., Kozlovsky A.G. Secondary Metabolites of the Siberian Strains Heterobasidion annosum sensu lato // Applied Biochemistry and Microbiology, 2020,   Т.  56,   В. 2,   С. 185-193,   DOI: 10.1134/S0003683820020039

9. Arlyapov  V.A., Khar’kova  A.S., Abramova  T.N., Kuznetsova  L.S., Ilyukhina  A.S., Zaitsev  M.G., Machulin A.V., Reshetilov A.N.  A Hybrid Redox-Active Polymer Based on Bovine Serum Albumin, Ferrocene, Carboxylated Carbon Nanotubes, and Glucose Oxidase  // Journal of Analytical Chemistry,  2020, V. 75, Is. 9, Р. 1189-1200,  DOI: 10.1134/S1061934820090026

10. Arlyapov V.A., Yudina N.Y., Asulyan L.D., Kamanina O.A., Alferov S.V., Shumsky A.N., Machulin A.V., Alferov V.A., Reshetilov A.N. Registration of BOD using Paracoccus yeei bacteria isolated from activated sludge // 3 Biotech, 2020.  V. 10, Is. 5, DOI: 10.1007/s13205-020-02199-0

11. Bidzhieva S.Kh., Sokolova D.Sh., Grouzdev D.S., Kostrikina N.A., Poltaraus A.B., Tourova T.P, Shcherbakova V.A., Troshina O.Yu ., Nazina T.N. Sphaerochaeta halotolerans sp. nov., a novel spherical halotolerant spirochete from a Russian heavy oil reservoir, emended description of the genus Sphaerochaeta, reclassification of Sphaerochaeta coccoides to a new genus Parasphaerochaeta gen. nov. as Pa // International journal of systematic and evolutionary microbiology, 2020, V. 70, Is. 8, P. 4748-4759, DOI 10.1099/ijsem.0.004340 .

12. But S.Y., Dedysh S.N., Popov V.O., Pimenov N.V., Khmelenina V.N. Construction of a Type-I Metanotroph with Reduced Capacity for Glycogen and Sucrose Accumulation // Applied Biochemistry and Microbiology, 2020, V. 56, Is. 5, P. 538-543, DOI: 10.1134/S0003683820050063

13.  Buzikov R.M., Piligrimova E.G., Shadrin A.M. Complete genome sequence of enterococcus faecium FS86, used for propagation of bacteriophages with therapeutic potential // Microbiology Resource Announcements, 2020, V. 9, Is. 39, DOI: 10.1128/MRA.00776-20

14. Chaplin A.V.,  Sokolova S.R., Shcherbakova V.A., Suzina N.E.,  Kochetkova T.O., Goltsov A.Y.,  Trofimov D.Y., EfimovB.A.  Hydrogeniiclostidium mannosilyticum gen. Nov., sp. nov. isolated from human faeces // International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology, 2020, V. 70, Is. 2, P.1210-1216, DOI: 10.1099/ijsem.0.003900.

15.  Chemodurova A.A., Kaparullina E.N., Machulin A.V.,  Sproer C., Lang E., Doronina N.V. Ancylobacter lacus sp. nov. and Ancylobacter plantiphilus sp. nov., Novel Aerobic Facultative Methylotrophic Bacteria // Microbiology, 2020, V. 89, Is.1, P. 35-43, DOI: 10.1134/S0026261720010051

16. Crous P. W.; Wingfield M. J.; Kachalkin A., … Chooi Y. -H. Fungal Planet description sheets: 1042-1111 // Persoonia, 2020, V. 44, P. 301-459,  DOI:  10.3767persoonia.2020.44.11

17. Dedysh S. N., Beletsky A. V., Ivanova A. A., Kulichevskaya I. S., Suzina N. N., Philippov D. A., Rakitin A. L., Mardanov A. V., Ravin N. V. Wide distribution of Phycisphaera-like planctomycetes from WD2101 soil group in peatlands and genome analysis of the first cultivated representative // Environmental microbiology, 2020, DOI: 10.1111/1462-2920.15360

18. Delegan Y., Sargsyan  A., Hovhannisyan  N.,  Babayan  B., Petrikov K., Vainstein M. Analysis of genome sequence and trehalose lipid production peculiarities of the thermotolerant Gordonia strain //Journal of Basic Microbiology, 2020, V. 60, Is. 1, Р. 14-21  DOI 10.1002/jobm.201900439.

19.  Delegan Y., Valentovich L., Vetrova A., Frantsuzova E., Kocharovskaya Y. Complete genome sequence of Gordonia sp. 135, a promising dibenzothiophene- and hydrocarbon-degrading strain // Microbiology Resource Announcements, 2020, V. 9, Is. 2, DOI: 10.1128/MRA.01450-19

20. Doronina N.V, Shmareva M.N., Kaparullina E.N., Vasilenko O.V., Tarlachkov S.V., Trotsenko Y.A. Reclassification of Methylarcula marina Doronina et al. 2000 as Paracoccus methylarcula nom. nov. // Microbiology, 2020, V. 89, Is 2, 1, P. 197-204, DOI: 10.1134/S0026261720020034

21. Dubinina, G., Leshcheva, N., Mikheeva, N., Spring, S., Neumann-Schaal, M., Shcherbakova, V., Grabovich, M. Description of Oceanispirochaeta crateris sp. nov. and reclassification of Spirochaeta perfilievii as Thiospirochaeta perfilievii gen. nov., comb. nov. // International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology, 2020, V.70, Is 12, P. 6373-6380,  DOI: 10.1099/ijsem.0.004544 

22.  Emelyanova E.V., Solyanikova I.P. Evaluation of phenol-degradation activity of Rhodococcus opacus 1CP using immobilized and intact cells  // International Journal of Environmental Science and Technology, 2020, V. 17,  №. 4, Р. 2279-2294, DOI: 10.1007/s13762-019-02609-8

23.  Esikova T.Z., Gafarov A.B., Anokhina T.O. Genetic Control of Degradation of epsilon-Caprolactam, Toluene, and meta-Xylene in Pseudomonas putida Strain CT3 // Microbiology, 2020, V. 89, Is. 2, P. 242-245,  DOI: 10.1134/S0026261720020046

24.  Filonov A.E., Delegan Ya.A., Puntus I.F., Valentovich  L., Akhremchuk  A., Evdokimova  O., Funtikova T., Zakharova M., Akhmetov L., Vetrova A., Titok  M. Complete Genome Sequence of Pseudomonas putida BS3701, a Promising Polycyclic Aromatic Hydrocarbon-Degrading Strain for Bioremediation Technologies // Microbiology resource announcements, 2020, V. 9, Is. 40, DOI: 10.1128/mra.00892-20

25.  Firsova Y.E., Torgonskaya M.L. Different roles of two groEL homologues in methylotrophic utiliser of dichloromethane Methylorubrum extorquens DM4 // Antonie van Leeuwenhoek, 2020, V. 113, Is.  1, P. 101-116,   DOI: 10.1007/s10482-019-01320-5.

26. Fursova  K., Sorokin  A., Sokolov S., Dzhelyadin  T.,  Shulcheva  I.,  Shchannikova  M.,  Nikanova  D.,  Artem'eva  O.,  Zinovieva  N., Brovko  F. Virulence Factors and Phylogeny of Staphylococcus aureus Associated With Bovine Mastitis in Russia Based on Genome Sequences // Front Vet Sci, 2020,  V.7, Is 135. DOI:10.3389/fvets.2020.00135

27. Glushakova  A.M,, Kachalkin A.V., Umarova  A.B., Butylkina  M.A., Kokoreva A.A., Ivanova  A.E., Bolotov  A.G., Dunaeva  E.A., Maksimova  I.A. Yeast Complexes in Urban Soils of Some Southern Cities of Russia (Krasnodar, Maykop, Simferopol, and Sochi) // Microbiology,  2020, V.  89, Is. 5, P.  603-608, DOI: 101134/S00262617200 50094

28. Golubev W.I. Mycocinogeny in fission yeast // Mycology and Phytopathology, 2020, V. 54, № 2, P. 150-152, DOI: 10.31857/S002636482002004X. 

29. Grytsay V.I., Medentsev A.G, Arinbasarova A.Y.  Autooscillatory dynamics in a mathematical model of the metabolic process in aerobic bacteria. Influence of the krebs cycle on the self-organization of a biosystem  //  Ukrainian Journal of Physics, 2020, V. 65,  Is. 5, P. 393-399, DOI: 10.15407/ujpe65.5.393

30. Grishin S.Y., Deryusheva E.I., Machulin A.V., Selivanova O.M., Glyakina A.V.,  Gorbunova E.Y., Mustaeva L.G., Azev V.N., Rekstina V.V, Kalebina T.S., Surin A.K., Galzitskaya O.V. Amyloidogenic propensities of ribosomal s1 proteins: Bioinformatics screening and experimental checking // International Journal of Molecular Sciences, V. 21, Is 15,  DOI: 10.3390/ijms21155199

31. Huy  L.D., Diep  N.T., Vu  T.K., Savinova  T.S., Donova M.V. An efficient procedure for the synthesis of 21-acetoxypregna-1,4,9(11),16-tetraene-3,20-dione // Combinatorial Chemistry and High Throughput Screening,  2020, V. 23, Is 3,  P. 225-231  DOI: 10.2174/1386207323666200219122644

32. Ingle A. P., Golińska P., Yadav A., Razzaghi-Abyaneh M., Patel M., Patel R., Plekhanova Y., Reshetilov A., Rai M. Nanotechnology: A new era in the revolution of drug delivery, diagnosis, and treatments of diseases Chapter 1 // in Nanobiotechnology in diagnosis, drug delivery and Treatment. Wiley & Sons Ltd. 2020, 448 p. ISBN: 978-1-119-67177-0.

33.  Kamzolova S. V., Morgunov I. G. Optimization of medium composition and fermentation conditions for alpha-ketoglutaric acid production from biodiesel waste by Yarrowia lipolyticа // Аpplied microbiology and biotechnology, 2020, V. 104, Is.18, P. 7979-7989,  DOI: 10.1007/s00253-020-10805-7

34.  Kamzolova S.V., Samoilenko V.A., Lunina J.N.,  Morgunov I.G. Effects of Medium Components on Isocitric Acid Production by Yarrowia lipolytica Yeast  // Fermentation, 2020, V. 6, Is 4, P.112-120, DOI.org/10.3390/fermentation6040112

35. Kanapina A.S., Marchenkov  V.V., Surin  A.K., Ivashina T.V. Mass Spectrometric Analysis of Acidic Exo-Oligosaccharides of Root Nodule Bacterium Rhizobium leguminosarum bv. viciae VF39 //  Microbiology, 2020, V. 89,Is. 5, P. 20-531,  DOI: 10.1134/ S0026261720050112

36. Karmanova A.N., Zimin A.A. Oceanic evolution of the enzyme repairing the UV-induced DNA lesions. // Conference Series, 2020, V. 1701, P. 012012, DOI: 10.1088/1742-6596/1701/1/012022

37. Karnachuk  O.V., Lukina  A.P., Kadnikov  V.V., Sherbakova V.A., Beletsky  A.V., Mardanov  A.V., Ravin  N.V. Targeted isolation based on metagenome-assembled genomes reveals a phylogenetically distinct group of thermophilic spirochetes from deep biosphere // Environmental microbiology, 2020, DOI: 10.1111/1462-2920.15218 

38. Kharkova A.S. Arlyapov V.A., Turovskaya A.D., Shvets V.I., Reshetilov A.N. A mediator microbial biosensor for assaying general toxicity // Еnzyme and microbial technology, 2020, V. 132, DOI: 10.1016/j.enzmictec.2019.109435

39.  Kollerov V., Shutov A., Kazantsev A.  and Donova M. Biotransformation of androstenedione and androstadienedione by selected Ascomycota and Zygomycota fungal strains // Phytochemictry, 2020, V.169, DOI: 10.1016/j.phytochem.2019.112160

40. Kozlovsky A.G., Kochkina G.A., Zhelifonova V.P., Antipova Т.V., Ivanushkina N.E., Ozerskaya S.M. Secondary metabolites of the genus Penicillium from undisturbed and anthropogenically altered Antarctic habitats // Folia Microbiologica, 2020, V. 65, Is. 1, P. 95-102,   DOI: 10.1007/s12223-019-00708-0

41. Kuznetsova  I.E, Smirnov  A.V., Plekhanova Y.V., Reshetilov A.N., Wang  G.-J. Effect of the Aperture of an Interdigital Transducer on the Characteristics of Its Output Signal in a Piezoelectric Plate // Bulletin of the Russian Academy of Sciences: Physics. 2020, V. 84, Is. 6,  P 644-647,  DOI: 10.3103/S1062873820060143

42. Lobastova T.G.,  Fokina V.V.,  Bragin E.Y.,  Shtratnikova V.Y, Starodumova I.P., Tarlachkov S.V., Donova M.V. Draft Genome Sequence of the Moderately Thermophilic Actinobacterial Steroid-Transforming Saccharopolyspora hirsuta subsp. hirsuta VKM Ac-666T Strain // Microbiology Resource Announcements, 2020, V. 9, Is. 1, DOI: 10.1128/MRA.01327-19

43. Lukasheva E.V., Makletsova M.G., Lukashev A.N., Babayeva G.I., Arinbasarova A.Yu., Medentsev A.G. Fungal Enzyme l-Lysine alfa-Oxidase Affects the Amino Acid Metabolism in the Brain and Decreases the Polyamine Level // Pharmaceuticals, 2020, V. 13, Is. 11, P. 398,  DOI: 10.3390/ph13110398

44. Maksimova  I.A., Glushakova  A.M., Thanh  V.N., Kachalkin A.V., Yamadazyma cocois f.A., sp. nov., an ascomycetous yeast isolated from coconuts //  International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology, 2020, V. 70, Is 5,  P. 3491-3496, DOI: 10.1099/ijsem.0.004203 

45. Maksimova  I.A., Kachalkin A.V., Yakovleva  E.Y, Krivosheina  M.G., Markov  A.V.; Yeast Communities Associated with Diptera of the White Sea Littoral  // Microbiology, 2020, V. 89, Is 2, P. 212-218,  DOI: 10.1134/S0026261720020071  

46. Marchenkov V., Gorokhovatsky A., Marchenko N., Ivashina T., Semisotnov G., Back to GroEL-Assisted Protein Folding: GroES Binding-Induced Displacement of Denatured Proteins from GroEL to Bulk Solution // Biomolecules, 2020, V. 10, Is. 1,    DOI: 10.3390/biom10010162

47.  Moiseeva O., Guillon J., Ferbeyre G. Senescence: A program in the road to cell elimination and cancer // Semin. Cancer Biol. 2020, DOI: 10.1016/j.semcancer.2020.12.017.

48.  Morgunov I.G., Kamzolova S.V., Karpukhina  O.V., Bokieva  S.B., Lunina J.N., Inozemtsev A.N. Microbiological production of isocitric acid from biodiesel waste and its effect on spatial memory // Microorganisms, 2020, V. 8, Is 4, DOI: 10.3390/microorganisms8040462

49. Musin E.V., Kim A.L., Dubrovskii A.V., Kudryashova E.B., Tikhonenko S.A.; Decapsulation of dextran by destruction of polyelectrolyte microcapsule nanoscale shell by bacillus subtilis bacteria // Nanomaterials, 2020, V.10, Is 1, DOI: 10.3390/nano10010012  

50. Nazina T.N., Bidzhieva S.K., Grouzdev D.S., Sokolova D.S., Tourova T.P., Parshina S.N., Avtukh A.N., Poltaraus A.B., Talybly A.K. Soehngenia longivitae sp. nov., a Fermenting Bacterium Isolated from a Petroleum Reservoir in Azerbaijan, and Emended Description of the Genus Soehngenia // Microorganisms, 2020, V.‏ 8, Is.‏12,   DOI: 10.3390/microorganisms8121967

51. Nikolaev Y.A., Pankratov T.A., Gannesen A.V., Kolganova T.V., Suzina N.E., Demkina E.V., El’-Registan G.I. Formation and Properties of Persister Cells of Staphylococcus capitis and Staphylococcus epidermidis, Bacteria Inhabiting Human Skin  // Microbiology,  2020, V. 89, Is. 4, P. 425-434. DOI: 10.1134/S0026261720040104  

52. Oshkin  I.Y., Khmelenina V.N., But S.Y., Miroshnikov  K.K., Belova  S.E., Khokhlachev  N.S., Chernushkin  D.V., Beletsky  A.V., Mardanov  A.V., Ravin  N.V., Popov  V.O., Dedysh  S.N., Pimenov  N.V. Analysis of the Complete Genome Sequence of Strain Concept-8, a Novel Representative of the Genus Methylococcus // Microbiology, 2020, V. 89, Is.3, P .309-317, DOI: 10.1134/S0026261720030121

53. Pankratov T.A., Grouzdev D.S., Patutina E.O., Kolganova T.V., Suzina N.E., Berestovskaya J.J.  Lichenibacterium ramalinae gen. nov, sp. nov., Lichenibacterium minor sp. nov., the first endophytic, betacarotene producing bacterial representatives from lichen thalli and the proposal of the new family Lichenibacteriaceae within the order Rhizobiales // Antonie van Leeuwenhoek, 2020, V. 113, Is. 4, P. 477-489, DOI: 10.1007/s10482-019-01357-6

54. Pigoleva S.V., Zakharchenko N.S, Furs O.V., Tarlachkov S.V., Funtikova T.V., Filonov A.E., Aripovskii A.V., Dyachenko O.V., Buryanov Y.I., Shevchuk T.V. Effects of Associative Microorganisms on Plant Growth and Resistance to Xenobiotics and Phytopathogens // Applied Biochemistry and Microbiology, 2020, V. 56, Is 4, 1, P. 473-482, DOI: 10.1134/S0003683820040134

55.  Polivtseva V.N., Anokhina T.O., Iminova L.R., Borzova O.V., Esikova T.Z., Solyanikova I.P. Evaluation of the Biotechnological Potential of New Bacterial Strains Capable of Phenol Degradation // Applied Biochemistry and Microbiology, 2020. V 56, Is 3, P 298-305, DOI: 10.1134/S0003683820030096  

56. Poshekhontseva V.Y., Fokina V.V., Sukhodolskaya G.V., Shutov A.A., Donova M.V.Study of the effect of lower eukaryotes on tacrolimus (FK-506) biosynthesis by the Streptomyces tsukubensis strain VKM Ac-2618D // Applied Biochemistry and Microbiology, 2020, V. 56, No. 8, P. 33–39. DOI: 10.1134/S0003683820080062

57.  Pozdnyakova-Filatova I., Petrikov K., Vetrova A., Frolova A., Streletskii R., Zakharova M. The Naphthalene Catabolic Genes of Pseudomonas putida BS3701: Additional Regulatory Control // Frontiers in Microbiology, 2020, V. 11, DOI: 10.3389/fmicb.2020.01217

58. Rai M., Bonde S., Yadav A., Plekhanova Y., Reshetilov A., Gupta I., Patrycja G.  Nanotenachnology-based promising strategies for the management of COVID-19: Current development and constraints // Expert Review of Antiinfective Therapy,  2020, DOI: 10.1080/14787210.2021.1836961  

59. Reshetilov A.N., Kitova A.E., Tarasov S.E., Plekhanova Y, Bykov А. G., Sundramoorthy A. K., Kuznetsova I. Е., Kolesov V.V., Gotovtsev P.M. Highly conductive polymer PEDOT: PSS - Application in biomedical and bioelectrochemical systems // Radioelektronika, Nanosistemy, Informacionnye Tehnologii, 2020, V. 12, Is. 4, P. 471-482, DOI: 10.17725/RENSIT.2020.12.471

60. Reshetnikov A.S., Rozova O.N., Trotsenko Y.A., But S.Yu., Khmelenina V.N., Mustakhimov I.I. Ectoine degradation pathway in halotolerant methylotrophs//PLoS ONE, 2020, v.15, Is 4, Номер статьи e0232244  DOI: 10.1371/journal.pone.0232244   

61. Rudenko  N.V., Karatovskaya  A.P., Zamyatina  A.V., Siunov A.V., Andreeva-Kovalevskaya Z.I., Nagel A.S., Brovko  F.A., Solonin A.S.  C-Terminal Domain of Bacillus cereus Hemolysin II Is Able to Interact with Erythrocytes // Russian Journal of Bioorganic Chemistry, 2020, V. 46, Is. 3,  P. 321-326 DOI: 10.1134/S1068162020030188

62. Rudenko  T.S., Tarlachkov S.V., Shatskiy  N.D., Grabovich  M.Y. Comparative genomics of beggiatoa leptomitoformis strains d-401 and d-402t with contrasting physiology but extremely high level of genomic identity // Microorganisms 2020, V. 8, Is 6, DOI: 10.3390/microorganisms8060928

63. Rudenko N., Nagel A., Zamyatina A., Karatovskaya A., Salyamov V., Andreeva-Kovalevskaya Zh., Siunov A., Kolesnikov A., Shepelyakaya A., Boziev K., Melnik B., Brovko F., Solonin A.  A Monoclonal Antibody against the C-Terminal Domain of Bacillus cereus Hemolysin II Inhibits HlyII Cytolytic Activity // Toxins, 2020, V.12, P.806  DOI:10.3390/toxins12120806

64. Ryazanova L.P., Ledova L.A., Andreeva N.A., Zvonarev A.N., Eldarov  M.A., Kulakovskaya T.V.  Inorganic Polyphosphate and Physiological Properties of Saccharomyces cerevisiae Yeast Overexpressing Ppn2 // Biochemistry, 2020, V. 85, Is. 4. P. 516-522, DOI: 10.1134/S0006297920040124

65. Salionov D.S., Poshekhontseva V.Yu., Fokina V.V., Shutov A.A., Nikolaeva V.M., Vasiarov G.D., Titova E.V., Karasev V.S., Staroverov S.M., and Donova M.V. Biosynthesis of tacrolimus by the Streptomyces tsukubensis VKM Aс-2618D strain in the presence of polymeric sorbents and development of a method for its isolation and purification // Applied Biochemistry and Microbiology, 2020,V. 56, N 6, P. 699–707. DOI: 10.1134/S0003683820060150.

66. Saratovskikh E.A., Avdeeva L.V., Shcherbakova V.A., Kazakov A.I., Yarullin R.N. Application of mutagenic treatment of active silt for oxidation of cellulose nitrate IOP // Conference Series: Materials Science and Engineering, 2020, V. 848, Is.1,   DOI: 10.1088/1757-899X/848/1/012053

67. Savinova T.S., Dovbnya D.V., Khomutov S.M., Kazantsev A.V., Huy L.D., Lukashev N.V., Donova M.V. Conversion of Soybean Phytosterol into Androsta-4,9(11)-diene-3,17-dione // Applied Biochemistry and Microbiology, 2020, V. 56, Is 4, P. 459-466. DOI: 10.1134/S0003683820030126

68. Shadrin V.S., Machulin A.V., Dorofeeva L.V., Chernyshov S.V., Mikoulinskaia G.V. Lysis of cells of diverse bacteria by l,d - peptidases of Escherichia coli bacteriophages RB43, RB49 and T5 // J. Appl. Microbiol, 2020, jam.14910  DOI: 10.1111/jam.14910

69. Shashkov  A.S., Tul’skaya  E.M., Dorofeeva L.V., Evtushenko L.I., Potekhina  N.V. Two Glycosyl 1-Phosphate Polymers and Teichulosonic Acid from Glutamicibacter protophormiae VKM Ac-2104T Cell Wall //  Biochemistry, 2020, V. 85, Is 5, P. 629-635, DOI:101134/ S0006297920050120 

70. Shashkov  A.S., Tul’skaya  E.M., Streshinskaya  G.M., Dmitrenok  A.S., Potekhina N.V., Senchenkova  S.N., Piskunkova  N.F., Dorofeeva L.V., Evtushenko L.I.  Rhamnomannans and Teichuronic Acid from the Cell Wall of Rathayibacter tritici VKM Ac-1603T // Biochemistry, 2020, V. 85, Is 3, P. 369-377, DOI:101134/ S0006297920030128

71. Shtratnikova  V.Y., Schelkunov  M.I., Fokina V.V., Bragin E.Y., Lobastova T.G.,  Shutov A.A., Kazantsev A.V., Donova M.V. Genome-wide transcriptome profiling provides insight on cholesterol and lithocholate degradation mechanisms in Nocardioides simplex VKM Ac-2033D  // Genes, 2020, V. 11, Is 10, P. 1-25, DOI: 10.3390/genes11101229

72. Sinitsyna  O.A., Rubtsova  E.A., Sinelnikov  I.G., Osipov D.O., Rozhkova  A.M., Matys V.Y., Bubnova T.V., Nemashkalov V.A., Sereda  A.S., Tcsherbakova  L.A., Sinitsyn A.P. Creation of Chitinase Producer and Disruption of Micromycete Cell Wall with the Obtained Enzyme Preparation // Biochemistry, 2020, V. 85, Is 6, 1, P. 717-724, DOI: 10.1134/S0006297920060097

73.  Skorynina A.V., Piligrimova E.G., Kazantseva O.A., Kulyabin V.A., Baicher S. D., Ryabova N.A., Shadrin A.M.  Bacillus-infecting bacteriophage Izhevsk harbors thermostable endolysin with broad range specificity. // PloS One, 2020, 15, e0242657. doi: 10.1371/journal.pone.0242657

74. Snigireva  A.V., Morenkov  O.S., Skarga  Y.Y., Lisov A., Lisova Z.A., Leontievsky A.A., Zhmurina  M.A., Petrenko  V.S, Vrublevskaya V.V. A 2,5-dihydroxybenzoic acid–gelatin conjugate inhibits the basal and hsp90-stimulated migration and invasion of tumor cells // Journal of Functional Biomaterials, 2020, V. 11, Is. 2, DOI: 10.3390/jfb110 220039

75.  Sviridov A.V., Shushkova T.V., Epiktetov D.O., Tarlachkov S.V., Ermakova I.T., Leontievskii A.A. Biodegradation of organophosphorus pollutants by soil bacteria: Biochemical aspects and unsolved problems // Biotekhnologiya, 2020, V. 36, Is. 4,  P. 126-135 DOI: 10.21519/0234-2758-2020-36-4-126-135

76. Tarlachkov S.V., Epiktetov D.O., Sviridov A.V., Shushkova T.V., Ermakova I.T., Leontievsky A.A. Draft Genome Sequence of Glyphosate-Degrading Achromobacter insolitus Strain Kg 19 (VKM B-3295), Isolated from Agricultural Soil // Microbiology Resource Announcements, 2020, V. 9, Is. 17, DOI: 10.1128/MRA.00284-20

77. Tarlachkov S.V., Starodumova I.P., Dorofeeva L.V., Prisyazhnaya N.V., Leyn  S.A., Zlamal  J.E., Albu  S., Nadler  S.A.,  Subbotin  S.A., Evtushenko L.I. Draft genome sequences of 13 plant-associated actinobacteria of the family microbacteriaceae // Microbiology Resource Announcements, 2020, V. 9, Is. 38, DOI: 10.1128/MRA.00795-20

78. Tarlachkov S.V., Starodumova I.P., Dorofeeva L.V., Prisyazhnaya N.V., Leyn  S.A., Zlamal  J.E., Elane  M.L., Osterman  A.L., Nadler  S.A., Subbotin  S.A., Evtushenko L.I.  Complete and draft genome sequences of 12 plant-associated Rathayibacter strains of known and putative new species // Microbiology Resource Announcements V. 9, Is 22, DOI: 10.1128/MRA.00316-20

79.  Tomashevsky A.A.,  Petrov V.V. Point mutations in the different domains of the Saccharomyces cerevisiae plasma membrane PMA1 ATPase cause redistribution among fractions of inorganic polyphosphates // Journal of Biomolecular Structure and Dynamics, 2020, DOI 10.1080/07391102.2020.1815582

80. Trilisenko L., Valiakhmetov A., Kulakovskaya T. Phosphate efflux as a test of plasma membrane leakage in Saccharomyces cerevisiae cells // Can J Microbiol, 2020, 1-5,  DOI: 10.1139/cjm-2020-0040

81. Trubitsina L. I.,  Lisov A.V.,  Belova O.V., Trubitsin I.V.,  Demin  V. V., Konstantinov  A. I., Zavarzina  A. G., Leontievsky A.A. Transformation of low molecular compounds and soil humic acid by two domain laccase of Streptomyces puniceus in the presence of ferulic and caffeic acids // PLOS ONE, 2020, V. 15, N. 9,  DOI:10.1371/ journal.pone.0239005

82. Zhao Y, Tian J, Zheng G, Chen J, Sun C, Yang Z, Zimin AA, Jiang W, Deng Z, Wang Z, Lu Y. Multiplex genome editing using a dCas9-cytidine deaminase fusion in Streptomyces // Sci China Life Sci, 2020, V. 63, Is. 7, P.1053-1062. DOI: 10.1007/s11427-019-1559-y.

83. Zhgun A., Dumina M., Valiakhmetov A., Eldarov M.  The critical role of plasma membrane H+-ATPase activity in cephalosporin C biosynthesis of Acremonium chrysogenum // PLOS One, 2020, V. 15, Is. 8, DOI: 10.1371/journal.pone.0238452

84. Zhorina  L.A., Rogovina  S.Z., Prut  E.V., Kuznetsova  O.P., Grachev  A.V., Ivanushkina N.N., Iordanskii  A.L., Berlin  A.A. Biodegradable Composites Based on Poly(3-hydroxybutyrate) and Polylactide Polyesters Produced from Vegetable Raw Materials  //  Polymer Science - Series A, 2020, V. 62, Is 4, P. 361-367, DOI: 10.1134/S0965545X200401361

85.  Zvonarev A, Farofonova V, Kulakovskaya E, Kulakovskaya T, Machulin A, Sokolov S, Dmitriev V. Changes in cell wall structure and protein set in Candida maltosa grown on hexadecane // Folia Microbiol, 2020,   DOI: 10.1007/s12223-020-00840-2

86. Агафонова Н.В., Доронина Н.В. Влияние штаммов Delftia spp. на рост ростков салата, выращенных в присутствии метсульфурон-метила // Актуальная биотехнология, 2020, № 3, C. 182

87. Агафонова Н.В., Екимова Г.А., Мустахимов И.И., Доронина Н.В. Аэробные метилобактерии как фитосимбионты // История науки и техники, 2020, № 11,  С. 36-51.

88. Андреева Н.А., Кулаковская Т.В., Ледова Л.А.,  Рязанова Л.П. , Трилисенко Л.В. Мониторинг неорганических полифосфатов в организме человека и окружающей среде: необходимость и методические подходы // История науки и техники, 2020, № 6, с. 36-41 DOI: 10.25791/intstg.06.2020.1189

89.  Аринбасарова А.Ю., Бирюкова Е.Н., Меденцев А.Г. Комплексный ответ дрожжей Yarrowia lipolytica на стрессовые воздействия // История науки и техники. 2020, № 11, С. 52-59, DOI: 10.25791/intstg.11.2020.1240

90. Архипова О.В. Анаэробная ферментная система, восстанавливающая метакрилат // История науки и техники, 2020, № 11, С. 60-64 DOI: 10.25791/intstg.11.2020.1241

91. Ахапкина  И.Г., Глушакова  А.М., Родионова  Е.Н., Качалкин А.В. Эффективность антифунгальных препаратов в отношении грибов рода Сandida, выделенных в московском регионе // Антибиотики и химиотерапия, 2020, т. 65, № 3-4, с. 16-22, DOI: 10.37489/0235-2990-2020-65-3-4-16-22

92. Ахапкина И.Г., Глушакова А.М., Родионова Е.Н., Качалкин А.В. Колонизационная активность клинических изолятов дрожжевых грибов рода Сandida и их антибиотикочувствительность // Журнал микробиологии, эпидемиологии и иммунобиологии, 2020, т. 97, № 5, с. 418-423  DOI: 10.36233/0372-9311-2020-97-5-4

93. Бабаева Г., Лукашева Е.В., Черкасова Ж.Р., Трещалина Е.М., Андронова Н.В., Федчиков Г.А., Цуркан С.А., Аринбасарова А.Ю., Меденцев А.Г. Скрининговое исследование эффективности и переносимости L-лизин-α-оксидазы из Trichoderma cf. aureoviride Rifai ВКМ F-4268D при пероральном введении на опухолевых моделях in vivo // Вопросы онкологии, 2020, т. 66,  № 6, с. 702-706  DOI: 10.37469/0507-3758-2020-66-6-702-706

94. Быков А.Г., Скрипачева О.В., Тарасов С.Е., Кленова Н.А., Решетилов А.Н. Штамм Gluconacetobacter sucrofermentans ВКПМ b-11267 как основа рецепторного элемента амперометрического биосенсора // Известия Тульского государственного университета. Естественные науки, 2020, № 1, С. 17-25

95. Вайнштейн М.Б., Делеган Я.А., Минкевич И.Г. Лаборатория физиологии микроорганизмов ИБФМ РАН, ее многолетний опыт и тенденции новых исследований // История науки и техники, 2020, № 6, с. 51-58.  DOI: 10.25791/intstg.06.2020.1191

96. Вайнштейн М.Б. К 55-летней годовщине Института биохимии и физиологии микроорганизмов им. Г.К. Скрябина Российской академии наук (ИБФМ РАН) // История науки и техники, 2020, № 6, С.3-5,  DOI: 10.25791/intstg.06.2020.1185

97. Голубев В.И.  Чувствительность Yarrowia lipolytica к микоцинам Wickerhamomyces // Проблемы медицинской микологии, 2020, т. 22, № 3, с. 26-28

98. Делеган Я.А., Французова Е.Э., Ветрова А.А. Штамм     Gordonia alkanivorans 135 – перспективный деструктор дибензотиофена  // Биотехнология, 2020, т. 36, No 4, с. 121–125 DOI: 10.21519/0234-2758-2020-36-4-121-125

99. Дмитриев В.В., Звонарев А.Н., Русакова Т.Г. Роль поверхностных и экзоцеллюлярных структур в адаптации микроорганизмов к экстремальным факторам внешней среды // История науки и техники, 2020, № 12, C. 20-33 DOI: 10.25792/intstg.12.2020.12-45

100. Дещеревская Н.О., Донова М.В. Определение способности бактерий рода Psychrobacter к трансформации стеринов и холевых кислот // Актуальная биотехнология, 2020, №3, Т.34, с.485

101. Донова М.В., Фокина В.В Лаборатория микробиологической трансформации органических соединений ИБФМ РАН: создание, становление и развитие // История науки и техники, 2020, в. 6, с.24-35 DOI: 10.25792/intstg.06.2020.1188

102.  Дуда В.И. Оcновные направления исследований лаборатории цитологии микроорганизмов. Итоги научной деятельности за последние пять лет 2015-2019 гг.) История науки и техники, 2020, № 6, С. 42-50   DOI: 10.25791/intstg.06.2020.1190

103. Замятина  А.В., Руденко  Н.В., Каратовская  А.П., Шепеляковская  А.О., Сиунов А.В., Андреева-Ковалевская Ж.И., Нагель А.С. Моноклональное антитело HlyIIC-15 против С-концевого домена HlyII B. cereus взаимодействует с сайтом узнавания тромбином // Биоорганическая химия, 2020, Т. 46, № 6, с. 753–760

104. Коломыцева М.П., Мясоедова Н.М., Моисеева О.В., Черных А.М., ГайдинаА.С., Шебанова А.Д., Ренфельд Ж.В. Биодеградация органических соединений // История Науки и Техники, 2020, №12, С.51-71 DOI: 10.25791/intstg.12.2020.1247

105. Кочкина Г.А., Иванушкина Н.Е., Антипова Т.В., Желифонова В.П., Козловский А.Г., Озерская С.М. Грибы многолетней мерзлоты: разнообразие, метаболиты, адаптация // История науки и техники, 2020, №11, с.19-35 DOI: 10.25791/intstg.11.2020.1238

106. Кошелева И.А., Филонов А.Е., Кочетков В.В., Пунтус И.Ф., Сиунова Т.В., Соколов С.Л., Измалкова Т.Ю., Гафаров А.Б., Сизова О.И., Сазонова О.И., Анохина Т.О., Ахметов Л.И., Ветрова А.А., Боронин А.М. Плазмиды бактерий рода Pseudomonas // История науки и техники, 2020, № 6, с. 59-78. DOI: 10.25791/intstg.06.2020.1192

107. Кувичкина Т.Н., Носулич В.Е., Доронина Н.В., Макаренко А.А., Решетилов А.Н. Окисление фенола иммобилизованными клетками Pseudomonas monteiliizima // Известия Тульского государственного университета. Естественные науки, 2020, № 2, с. 44-55

108. Кузнецова И. Е., Смирнов А. В., Плеханова Ю. В., Решетилов А. Н., Ван Г.-Ц. Влияние апертуры встречно-штыревого преобразователя на характеристики его выходного сигнала в пьезоэлектрической пластине // Известия российской академии наук. Серия физическая, 2020, Т.84, №6, с. 790-793  DOI: 10.31857/S0367676520060162

109. Лисов А.В., Заварзина А.Г., Белова О.В., Леонтьевский А.А.  Трансформация гуминовой кислоты грибом Сerrena unicolor в условиях роста на целлюлозе и глюкозе // Микробиология, 2020, Т. 89, N. 3, С. 300–307 DOI: 10.31857/S0026365620030118

110. Михедова Е. Е., Абашина Т. Н. Применение биопрепаратов в задачах рекультивации нефтезагрязнений почвенного покрова // Защита окружающей среды в нефтегазовом комплексе, 2020,  № 4 (295),  С. 10-14.

111.  Нагель А.С., Андреева-Ковалевская Ж.И., Сиунов А.В., Солонин А.С. Челночная векторная плазмида с turbogfp в качестве репортерного гена для анализа промоторной активности в клетках E. coli и B. subtilis // Технологии живых систем, 2020, Т. 17, № 4, С. 18–30

112. Никулин Н. А., Лу Иньхуа, Зимин А.А. Эволюционные связи актинофага Gilgamesh и перспективы его использования для конструирования продуцентов антибиотиков. // Сб. научных трудов Краснодарского научного центра по зоотехнии и ветеринарии, 2020, Т. 9, № 1, стр. 229-237  DOI:10.34617/7b8b-3147

113.  Петров В.В. Структурно-функциональная организация рма1 h+-atфазы дрожжей. // История науки и техники, 2020, № 12,  с. 34-40 DOI: 10.25791/intstg.12.2020.12-46

114. Решетилов А.Н. Современные методы в создании микробных биосенсоров и биотопливных элементов // История науки и техники, № 6, с. 15-23 DOI:10.25791/intstg.06.2020.1187

115. Решетилов А.Н., Готовцев П.М., Сандраморти А.К., Василов Р.Г.  Биосенсоры – движение от макро- к микро- и наноразмерам // Российские нанотехнологии, т. 15, № 1, с. 14-21  DOI: 10.1134/S1992722320010045

116. Ривкина Е.М., Федоров-Давыдов Д.Г., Захарюк А.Г., Щербакова В.А., Вишнивецкая Т.А. Свободное железо и железовосстанавливающие микроорганизмы в почвах и многолетнемерзлых отложениях северо-востока Сибири // Почвоведение, 2020,  № 10, с. 1247-1261 DOI: 10.31857/S0032180X20100160

117. Сиунов А.В., Борисова  М.П., Андреева-Ковалевская Ж.И., Нагель А.С., Колесников А. С., Сурин А.К., Солонин А.С. Порообразующие свойства хеликазы SsoHel308 из Saccharolobus solfataricus // Биофизика, 2020, Т. 65, № 6. с. 1–7

118. Тарасов С.Е., Плеханова Ю.В., Быков А.Е., Кленова Н.А., Решетилов А.Н. Стимулирующие эффекты мультистенных углеродных нанотрубок на иммобилизованные бактериальные клетки Gluconacetobacter sucrofermentas ВКПМ B-11267 // Российские нанотехнологии, 2020, т. 15, № 1, с. 86–89 DOI: 10.1134/S1992722320010124

119. Трилисенко Л.В., Кулаковская Т.В. Роль неорганических полифосфатов в адаптации дрожжей к перекисному стрессу // Известия Тулгу. Естественные науки, 2020, В.1,  с. 26-32

120. Трубицина Л.И., Трубицин И.В., Лисов А.В. Оптимизация методики получения рекомбинантных двухдоменных лакказ // Сорбционные и хроматографические процессы, 2020, Т. 20, № 1, С. 109-114

121. Фокина В.В., Брагин Е.Ю., Штратникова В.Ю., Донова М.В. Дифференциальная экспрессия генов катаболизма стероидов у Nocardioides simplex ВКМ Ас-2033Д при индукции ацетатом кортизона // Актуальная биотехнология, 2020, № 3, с.604

122. Щербакова В.А. Исследование анаэробных микроорганизмов в Институте биохимии и физиологии микроорганизмов им. Г.К. Скрябина // История науки и техники, 2020, № 6,  с. 6-14,  DOI: 10.25791/intstg.06.2020.1186

Патенты  2018-2019 гг.

  • Патент РФ на изобретение № 2646160 от 01.03.2018

Название: «Штамм бактерий Pseudomonas fluorescens  для защиты растений от фитопатогенных грибов и бактерий и стимуляции растений», авторы: Анохина Т.О., Сиунова Т.В., Сизова О.И., Кочетков В.В, Боронин А.М.

  • Патент РФ на изобретение № 2663342 от 03.08.2018

Название: «Способ получения лакказ гриба Myrothecium verrucaria ВКМ F-3851,  трансформирующие фенольные соединения в нейтрально- щелочных условиях среды», авторы: Коломыцева М.П., Мясоедова Н.М., Черных А.М., Подъяблонская Е.В., Головлева Л.А.

  • Патент РФ на изобретение № 2664483 от 17.08.2018

Название: «Способ получения оксидаз Curvularia geniculata ВКМ F-3561, активных с фенольными соединениями в нейтральных условиях среды», авторы: Коломыцева М.П., Мясоедова Н.М., Черных А.М., Подъяблонская Е.В., Головлева Л.А., Ренфельд Ж.В.

  • Патент РФ на изобретение № 2647767 от 19.03.2018

Название: «Штамм Rhizoctonia solanti F-895- продуцент алкалофильных  лакказ, активных с  фенилпропаноидами», авторы: Коломыцева М.П., Мясоедова Н.М., Черных А.М., Подъяблонская Е.В., Данилогорская А.А., Головлева Л.А.

  • Патент РФ на изобретение № 2017136245 от 22.05.2019

Название: «Консорциум микроорганизмов для очистки поверхностных вод и седиментов Балтийского моря от нефти и нефтепродуктов», авторы Соколов С.Л., Гафаров А.Б., Сазонова О.И., Ветрова А.А., Иванова А.А., Кошелева И.А., Петриков К.В.

  • Патент РФ на изобретение № 2705260 от 06.11.2019

Название «Ферментный препарат для гидролиза растительного сырья с помощью рекомбинантных продуцентов на основе Pichia pastoris», авторы: Белова О.В., Лисов А.В., Леонтьевский А.А., Ковалевская Ж.И., Солонин А.С., Шадрин А.М., Лисова З.А., Захарова М.В.


142290 Московская область, г.Пущино, пр-т Науки, д.5, Тел.: +7(4967)733962,  adm@ibpm.ru, www.ibpm.ru

Разработка сайта - Alces